RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478911.1

SUPT20H-215, Transcript of SPT20 homolog, SAGA complex component, humanhuman

TSL 3

Gene SUPT20H, Length 591 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT20H-215ENST00000478911 TMC5Q6UXY8 1006 aa4.51□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa4.51□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa4.51□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 C7orf31Q8N865 590 aa4.51□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 DTX3Q8N9I9 347 aa4.51□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 LMBR1Q8WVP7 490 aa4.51□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 E2F7Q96AV8 911 aa4.51□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 CHMP4CQ96CF2 233 aa4.51□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 MAML3Q96JK9 1138 aa4.51□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 FOXB1Q99853 325 aa4.51□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 UCKL1Q9NWZ5 548 aa4.51□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 TRIM75PA6NK02 468 aa4.5□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 GOLGA8AA7E2F4 631 aa4.5□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 GOLGA8BA8MQT2 603 aa4.5□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 MARCH6O60337 910 aa4.5□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 CYP2C8P10632 490 aa4.5□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 PFKLP17858 780 aa4.5□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 GPR3P46089 330 aa4.5□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 EPHB3P54753 998 aa4.5□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 SLC6A3Q01959 620 aa4.5□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 MYBPC3Q14896 1274 aa4.5□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 PTPN21Q16825 1174 aa4.5□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 SKIDA1Q1XH10 827 aa4.5□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa4.5□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa4.5□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 ZBTB46Q86UZ6 589 aa4.5□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 IGDCC3Q8IVU1 814 aa4.5□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa4.5□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa4.5□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 MZB1Q8WU39 189 aa4.5□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP4.5□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 ACAP3Q96P50 834 aa4.5□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa4.5□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 TMEM209Q96SK2 561 aa4.5□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 ORAI2Q96SN7 254 aa4.5□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 SYT3Q9BQG1 590 aa4.5□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 MYL10Q9BUA6 226 aa4.5□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 AMNQ9BXJ7 453 aa4.5□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 SLC13A1Q9BZW2 595 aa4.5□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 POFUT1Q9H488 388 aa4.5□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 INCENPQ9NQS7 918 aa4.5□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa4.5□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 AKAP10O43572 662 aa4.49□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 RBP3P10745 1247 aa4.49□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 PI3P19957 117 aa4.49□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 ENPP1P22413 925 aa4.49□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 RGS3P49796 1198 aa4.49□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 RAB27AP51159 221 aa4.49□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 MANFP55145 182 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 ITGA1P56199 1179 aa4.49□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 ROM1Q03395 351 aa4.49□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa4.49□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 SLFN12LQ6IEE8 588 aa4.49□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 LRSAM1Q6UWE0 723 aa4.49□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa4.49□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 FEZF2Q8TBJ5 459 aa4.49□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 HOOK2Q96ED9 719 aa4.49□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 FAXDC2Q96IV6 333 aa4.49□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 ANO3Q9BYT9 981 aa4.49□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 PCDH18Q9HCL0 1135 aa4.49□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 DLL4Q9NR61 685 aa4.49□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa4.49□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 GALNT8Q9NY28 637 aa4.49□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 CHPF2Q9P2E5 772 aa4.49□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa4.49□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 PRSS38A1L453 326 aa4.48□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 N4BP3O15049 544 aa4.48□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 CFBP00751 764 aa4.48□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 CLEC2LP0C7M8 214 aa4.48□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 ECE1P42892 770 aa4.48□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 KRT85P78386 507 aa4.48□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 ADCY2Q08462 1091 aa4.48□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 ADAM9Q13443 819 aa4.48□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 RTP5Q14D33 572 aa4.48□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP4.48□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 CT83Q5H943 113 aa4.48□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 KIAA1841Q6NSI8 718 aa4.48□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 PGM2L1Q6PCE3 622 aa4.48□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 FMNL3Q8IVF7 1028 aa4.48□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa4.48□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 CALML6Q8TD86 181 aa4.48□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa4.48□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 FERMT2Q96AC1 680 aa4.48□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 GORASP1Q9BQQ3 440 aa4.48□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 BTBD2Q9BX70 525 aa4.48□□□□□ -1.69
SUPT20H-215ENST00000478911 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms