RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959		A0A087WWV3	80 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959		M0QZ92	97 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	MARCH6	O60337	910 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	GJB5	O95377	273 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	MCTP1	Q6DN14	999 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM228A	Q86W67	206 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	PHOSPHO2	Q8TCD6	241 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	APBB2	Q92870	758 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	12.47	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	CERS4	Q9HA82	394 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	PADI3	Q9ULW8	664 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	AKT3	Q9Y243	479 aa		12.47	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		12.46	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	TLL1	O43897	1013 aa		12.46	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	MED24	O75448	989 aa		12.46	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLITRK3	O94933	977 aa		12.46	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	UPP2	O95045	317 aa		12.46	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	GPC3	P51654	580 aa		12.46	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	TAP1	Q03518	808 aa		12.46	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	PAK2	Q13177	524 aa		12.46	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	ADGRE1	Q14246	886 aa		12.46	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	IER5	Q5VY09	327 aa		12.46	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	C4orf19	Q8IY42	314 aa		12.46	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		12.46	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		12.46	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	XPNPEP1	Q9NQW7	623 aa		12.46	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		12.46	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		12.46	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	PCDHA12	Q9UN75	941 aa		12.46	□□□□□ -0.41
GTPBP1-208	ENST00000475959	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		12.46	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	PP2D1	A8MPX8	630 aa		12.45	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	RFXAP	O00287	272 aa		12.45	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	MAGEB2	O15479	319 aa		12.45	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	EFCAB14	O75071	495 aa		12.45	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	AMH	P03971	560 aa		12.45	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		12.45	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	FGFR4	P22455	802 aa		12.45	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	TEC	P42680	631 aa		12.45	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRAPPC10	P48553	1259 aa		12.45	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	HTRA4	P83105	476 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	IL17A	Q16552	155 aa		12.45	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	POTEG	Q6S5H5	508 aa		12.45	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	TPH2	Q8IWU9	490 aa		12.45	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	NME8	Q8N427	588 aa		12.45	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	IL27	Q8NEV9	243 aa		12.45	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	MAP7D2	Q96T17	732 aa		12.45	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		12.45	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		12.45	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	EIF4ENIF1	Q9NRA8	985 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		12.45	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	KIF3A	Q9Y496	699 aa		12.45	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	COL6A3	P12111	3177 aa		12.45	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	EYS	Q5T1H1	3165 aa		12.45	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	LINC01553	A4QN01	128 aa		12.44	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959		H3BQV1	296 aa		12.44	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	RPS6KA5	O75582	802 aa		12.44	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	GATM	P50440	423 aa		12.44	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	PTGDR	Q13258	359 aa		12.44	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	EMC2	Q15006	297 aa		12.44	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	ECM1	Q16610	540 aa		12.44	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	FERMT3	Q86UX7	667 aa		12.44	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	KSR1	Q8IVT5	923 aa		12.44	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	CRIPAK	Q8N1N5	446 aa		12.44	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	USP38	Q8NB14	1042 aa		12.44	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		12.44	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		12.44	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	TOP1MT	Q969P6	601 aa		12.44	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	CEP170P1	Q96L14	293 aa		12.44	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		12.44	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		12.44	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		12.44	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		12.44	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		12.44	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959		A0A087WZ62	844 aa		12.43	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	ENPP3	O14638	875 aa		12.43	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	LYPLA2	O95372	231 aa		12.43	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	LINC00271	P0C7V0	271 aa		12.43	□□□□□ -0.42
GTPBP1-208	ENST00000475959	FOSL2	P15408	326 aa		12.43	□□□□□ -0.42

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