RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473244.5

MED15-222, Transcript of mediator complex subunit 15, human

TSL 1 (best)

Gene MED15, Length 2,733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MED15-222	ENST00000473244	ASAP2	O43150	1006 aa		21.31	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	BAG3	O95817	575 aa		21.31	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	RFC4	P35249	363 aa		21.31	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	STAT3	P40763	770 aa		21.31	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	NOV	P48745	357 aa		21.31	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	21.31	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	21.31	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	CRYM	Q14894	314 aa		21.31	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	SPDYC	Q5MJ68	293 aa		21.31	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	TEX11	Q8IYF3	940 aa		21.31	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	21.31	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	CCDC63	Q8NA47	563 aa		21.31	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	NEK9	Q8TD19	979 aa		21.31	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		21.31	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	PGM2	Q96G03	612 aa		21.31	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	ERP44	Q9BS26	406 aa		21.31	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		21.31	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		21.31	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		21.31	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	AMFR	Q9UKV5	643 aa		21.31	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	RPTOR	Q8N122	1335 aa		21.31	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		21.31	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	POTEF	A5A3E0	1075 aa		21.3	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	RTN2	O75298	545 aa		21.3	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	MED24	O75448	989 aa		21.3	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	GFPT2	O94808	682 aa		21.3	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	POTEI	P0CG38	1075 aa		21.3	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	CASP4	P49662	377 aa		21.3	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	PMS2	P54278	862 aa		21.3	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	21.3	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	POTEG	Q6S5H5	508 aa		21.3	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		21.3	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	21.3	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	RAB17	Q9H0T7	212 aa		21.3	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	GCNT4	Q9P109	453 aa		21.3	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		21.3	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	21.3	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	SLC12A3	P55017	1021 aa		21.3	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	PLTP	P55058	493 aa		21.3	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	NPEPPS	P55786	919 aa		21.3	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	ITIH4	Q14624	930 aa		21.3	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		21.3	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	21.3	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		21.3	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	21.3	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	SNX24	Q9Y343	169 aa		21.3	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		21.3	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	GSTA1	P08263	222 aa		21.29	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	CLTA	P09496	248 aa		21.29	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	SLC29A2	Q14542	456 aa		21.29	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		21.29	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		21.29	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	SLC35C1	Q96A29	364 aa		21.29	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	EBF2	Q9HAK2	575 aa		21.29	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		21.29	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		21.29	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	MARCH6	O60337	910 aa		21.29	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	21.29	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	PPAT	Q06203	517 aa		21.29	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	AADACL2	Q6P093	401 aa		21.29	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	21.29	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		21.29	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		21.29	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	INTU	Q9ULD6	942 aa		21.29	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		21.29	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	AFF2	P51816	1311 aa		21.29	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	BTD	P43251	543 aa		21.28	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	MYO1E	Q12965	1108 aa		21.28	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	JAML	Q86YT9	394 aa		21.28	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	21.28	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	ALG3	Q92685	438 aa		21.28	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	21.28	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		21.28	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	21.28	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	EVI5	O60447	810 aa		21.28	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	21.28	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	KRT18	P05783	430 aa	Known RBP	21.28	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	ABCB4	P21439	1286 aa		21.28	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	ANXA13	P27216	316 aa		21.28	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	PSMC6	P62333	389 aa		21.28	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	PLS1	Q14651	629 aa		21.28	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	21.28	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	DENND2C	Q68D51	928 aa		21.28	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	TRPM8	Q7Z2W7	1104 aa		21.28	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	SFR1	Q86XK3	245 aa		21.28	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		21.28	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	EPS8L3	Q8TE67	593 aa	Known RBP	21.28	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		21.28	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	21.28	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		21.28	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		21.28	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		21.28	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	GGT7	Q9UJ14	662 aa		21.28	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	NCAN	O14594	1321 aa		21.28	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	21.28	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	IFNAR2	P48551	515 aa		21.28	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		21.28	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	KCNJ2	P63252	427 aa		21.27	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	21.27	■■□□□ 1
MED15-222	ENST00000473244	VPS36	Q86VN1	386 aa		21.27	■■□□□ 1

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