RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471526.1

SHQ1-206, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 4

Gene SHQ1, Length 553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-206ENST00000471526 CLCN3P51790 818 aa21.79■■□□□ 1.08
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SHQ1-206ENST00000471526 FAM228AQ86W67 206 aa21.79■■□□□ 1.08
SHQ1-206ENST00000471526 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
SHQ1-206ENST00000471526 CD207Q9UJ71 328 aa21.79■■□□□ 1.08
SHQ1-206ENST00000471526 CEP131Q9UPN4 1083 aa21.79■■□□□ 1.08
SHQ1-206ENST00000471526 REC8O95072 547 aa21.78■■□□□ 1.08
SHQ1-206ENST00000471526 NLRP5P59047 1200 aa21.78■■□□□ 1.08
SHQ1-206ENST00000471526 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
SHQ1-206ENST00000471526 EFCAB12Q6NXP0 572 aa21.78■■□□□ 1.08
SHQ1-206ENST00000471526 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
SHQ1-206ENST00000471526 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa21.78■■□□□ 1.08
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SHQ1-206ENST00000471526 CCDC136Q96JN2 1154 aa21.78■■□□□ 1.08
SHQ1-206ENST00000471526 AKT3Q9Y243 479 aa21.78■■□□□ 1.08
SHQ1-206ENST00000471526 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa21.78■■□□□ 1.08
SHQ1-206ENST00000471526 C19orf67A6NJJ6 358 aa21.77■■□□□ 1.08
SHQ1-206ENST00000471526 WDR64B1ANS9 1081 aa21.77■■□□□ 1.08
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SHQ1-206ENST00000471526 FAM167AQ96KS9 214 aa21.77■■□□□ 1.08
SHQ1-206ENST00000471526 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa21.77■■□□□ 1.08
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SHQ1-206ENST00000471526 DISC1Q9NRI5 854 aa21.77■■□□□ 1.08
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SHQ1-206ENST00000471526 CHMP2AO43633 222 aa21.76■■□□□ 1.07
SHQ1-206ENST00000471526 ZNF862O60290 1169 aa21.76■■□□□ 1.07
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SHQ1-206ENST00000471526 GJA10Q969M2 543 aa21.76■■□□□ 1.07
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SHQ1-206ENST00000471526 OATP04181 439 aa21.75■■□□□ 1.07
SHQ1-206ENST00000471526 USP11P51784 963 aa21.75■■□□□ 1.07
SHQ1-206ENST00000471526 FAM189BP81408 668 aa21.75■■□□□ 1.07
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SHQ1-206ENST00000471526 TMEM161AQ9NX61 479 aa21.75■■□□□ 1.07
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SHQ1-206ENST00000471526 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa21.72■■□□□ 1.07
SHQ1-206ENST00000471526 EYA4O95677 639 aa21.71■■□□□ 1.07
SHQ1-206ENST00000471526 GLP2RO95838 553 aa21.71■■□□□ 1.07
SHQ1-206ENST00000471526 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa21.71■■□□□ 1.07
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SHQ1-206ENST00000471526 MIER3Q7Z3K6 550 aa21.71■■□□□ 1.07
SHQ1-206ENST00000471526 C22orf23Q9BZE7 217 aa21.71■■□□□ 1.07
SHQ1-206ENST00000471526 TMEM117Q9H0C3 514 aa21.71■■□□□ 1.07
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