RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468747.5

FAM107B-211, Transcript of family with sequence similarity 107 member B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM107B, Length 2,633 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM107B-211ENST00000468747 ZHX3Q9H4I2 956 aa24.35■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 DRP2Q13474 957 aa24.35■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 QRICH1Q2TAL8 776 aa24.35■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 TRIM31Q9BZY9 425 aa24.35■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 USP17L15C9J2P7 530 aa24.34■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 USP17L13C9JLJ4 530 aa24.34■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 USP17L11C9JVI0 530 aa24.34■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 USP17L18D6R9N7 530 aa24.34■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 USP17L22D6RA61 530 aa24.34■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 USP17L17D6RBQ6 530 aa24.34■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 USP17L19D6RCP7 530 aa24.34■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 USP17L20D6RJB6 530 aa24.34■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 USP17L24Q0WX57 530 aa24.34■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 KRT71Q3SY84 523 aa24.34■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 SLFN13Q68D06 897 aa24.34■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 USP17L6PQ6QN14 398 aa24.34■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 MKL1Q969V6 931 aa24.34■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 HDAC9Q9UKV0 1011 aa24.34■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 NR2E1Q9Y466 385 aa24.34■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 SCN9AQ15858 1988 aa24.34■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 POTEB3A0JP26 581 aa24.34■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 POTECB2RU33 542 aa24.34■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 GDF11O95390 407 aa24.34■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 NR2F2P24468 414 aa24.34■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 RDXP35241 583 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 POTEBQ6S5H4 581 aa24.34■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 PEX26Q7Z412 305 aa24.34■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 GPBP1Q86WP2 473 aa24.34■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 PLA2G4BP0C869 781 aa24.33■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 CDR1P51861 262 aa24.33■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP24.33■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 TATDN2Q93075 761 aa24.33■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 NYAP2Q9P242 653 aa24.33■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 SLX4Q8IY92 1834 aa24.33■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 C5orf60A6NFR6 353 aa24.33■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 OPLAHO14841 1288 aa24.33■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 MARCH6O60337 910 aa24.33■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 SCTRP47872 440 aa24.33■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 AGBL2Q5U5Z8 902 aa24.33■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 TATDN1Q6P1N9 297 aa24.33■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 PARP9Q8IXQ6 854 aa24.33■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 TRIM51Q9BSJ1 452 aa24.33■■□□□ 1.49
FAM107B-211ENST00000468747 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 F8VZ95 297 aa24.32■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 SNAP25P60880 206 aa24.32■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 GJB7Q6PEY0 223 aa24.32■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 CCDC65Q8IXS2 484 aa24.32■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa24.32■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 C7orf43Q8WVR3 580 aa24.32■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 MCM8Q9UJA3 840 aa24.32■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 SERPINA10Q9UK55 444 aa24.32■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 PCDHA12Q9UN75 941 aa24.32■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa24.32■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 PON1P27169 355 aa24.32■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa24.32■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 PAEPP09466 180 aa24.31■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 CYP11B2P19099 503 aa24.31■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 JAG1P78504 1218 aa24.31■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 ICA1Q05084 483 aa24.31■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 CEP57Q86XR8 500 aa24.31■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 C3orf20Q8ND61 904 aa24.31■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 CETN3O15182 167 aa24.31■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 COPB2P35606 906 aa24.31■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 C10orf76Q5T2E6 689 aa24.31■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 DAAM2Q86T65 1068 aa24.31■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa24.31■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 SIPA1L1O43166 1804 aa24.31■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 DRD4P21917 467 aa24.31■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 MTMR3Q13615 1198 aa24.31■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 SNCBQ16143 134 aa24.31■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 ARSHQ5FYA8 562 aa24.31■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 RASGEF1CQ8N431 466 aa24.31■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 DCAF4Q8WV16 495 aa24.31■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 CNKSR1Q969H4 720 aa24.31■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 STAT3P40763 770 aa24.3■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 CPLX4Q7Z7G2 160 aa24.3■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 SLFN11Q7Z7L1 901 aa24.3■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 NT5DC3Q86UY8 548 aa24.3■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 SCLT1Q96NL6 688 aa24.3■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 F5H6K3 240 aa24.3■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 CCDC188H7C350 402 aa24.3■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 KLRC3Q07444 240 aa24.3■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 EXOC3L4Q17RC7 722 aa24.3■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
FAM107B-211ENST00000468747 ATP8B4Q8TF62 1192 aa24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms