RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466222.6

CAPN3-209, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 2

Gene CAPN3, Length 1,934 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-209ENST00000466222 COASYQ13057 564 aa20.58■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 LRRC41Q15345 812 aa20.58■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 XKR9Q5GH70 373 aa20.58■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 OLFML2BQ68BL8 750 aa20.58■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 PADI6Q6TGC4 694 aa20.58■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 AFG1LQ8WV93 481 aa20.58■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 LRRC27Q9C0I9 530 aa20.58■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 FANCLQ9NW38 375 aa20.58■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 GPR25O00155 361 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 ZSCAN12O43309 604 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 USO1O60763 962 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
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CAPN3-209ENST00000466222 EHHADHQ08426 723 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 KCTD17Q8N5Z5 321 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 ARHGAP6O43182 974 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 STAT5BP51692 787 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 SOX10P56693 466 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 DUSP28Q4G0W2 176 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 TRPV1Q8NER1 839 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
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CAPN3-209ENST00000466222 ZNF18P17022 549 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 TNFAIP2Q03169 654 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 DAW1Q8N136 415 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 GLG1Q92896 1179 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 CEP170P1Q96L14 293 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 GPRC5CQ9NQ84 441 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 FRMD3A2A2Y4 597 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 ELNP15502 786 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 PMS1P54277 932 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 ETF1P62495 437 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 CBX1P83916 185 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 LAMC2Q13753 1193 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 IQSEC1Q6DN90 963 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 MAPK7Q13164 816 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 KIF22Q14807 665 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 SFR1Q86XK3 245 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 ADSSL1Q8N142 457 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 ANKEF1Q9NU02 776 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 CTNND2Q9UQB3 1225 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 HIP1RO75146 1068 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 OATP04181 439 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 CASP5P51878 434 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 MTERF2Q49AM1 385 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 XKR3Q5GH77 459 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 CCDC65Q8IXS2 484 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 AZI2Q9H6S1 392 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 TRIM49BA6NDI0 452 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF286BP0CG31 522 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 SYT10Q6XYQ8 523 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 OR6J1Q8NGC5 347 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 AFAP1L1Q8TED9 768 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 EEF2KMTQ96G04 330 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 CYP26B1Q9NR63 512 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 LGR5O75473 907 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 FAM26FQ5R3K3 315 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 OTUD6AQ7L8S5 288 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 PPTC7Q8NI37 304 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 ZBTB10Q96DT7 871 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 RNPEPQ9H4A4 650 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 MCM3APO60318 1980 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 STX10O60499 249 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 TBCAO75347 108 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 HSPA6P17066 643 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 GUCY2CP25092 1073 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 DMTNQ08495 405 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 FAM160B1Q5W0V3 765 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 MYCT1Q8N699 235 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 NELFBQ8WX92 580 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 SRRDQ9UH36 339 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 DOCK3Q8IZD9 2030 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 ZNF236Q9UL36 1845 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPN3-209ENST00000466222 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 FAM13AO94988 1023 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPN3-209ENST00000466222 LGALS2P05162 132 aa20.51■□□□□ 0.87
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