RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462494.5

ACTB-207, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 2,245 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-207ENST00000462494 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 SLX4Q8IY92 1834 aa18.48■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 MYO1CO00159 1063 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 H2AFZP0C0S5 128 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 PRELPP51888 382 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 PPP2R5CQ13362 524 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 NNTQ13423 1086 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 STYK1Q6J9G0 422 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 H2AFVQ71UI9 128 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 FAM178BQ8IXR5 827 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 TPCN2Q8NHX9 752 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 BORCS6Q96GS4 357 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 ZNF577Q9BSK1 485 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 TMOD2Q9NZR1 351 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 FBXL5Q9UKA1 691 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP18.47■□□□□ 0.551e-323■□□□□ 8.9
ACTB-207ENST00000462494 KRT14P02533 472 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 STAT1P42224 750 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 TTMPQ5BVD1 217 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 CFAP58Q5T655 872 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 PEX26Q7Z412 305 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 C10orf67Q8IYJ2 551 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 LRRC57Q8N9N7 239 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 FLAD1Q8NFF5 587 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 SLC5A5Q92911 643 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 AP1M1Q9BXS5 423 aa18.47■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 TRIM66O15016 1216 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 PPIP5K2O43314 1243 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 EVI5O60447 810 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 FERP16591 822 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 TRAF1Q13077 416 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 PLS1Q14651 629 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 ODR4Q5SWX8 454 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 KCTD16Q68DU8 428 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 HS2ST1Q7LGA3 356 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 PBKQ96KB5 322 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 CAPS2Q9BXY5 557 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 TMX2Q9Y320 296 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 KIF13BQ9NQT8 1826 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 YDJCA8MPS7 323 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 PPFIA4O75335 1185 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 ARP10275 920 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 CEP55Q53EZ4 464 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 ZNF720Q7Z2F6 126 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 DAAM2Q86T65 1068 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 RDH13Q8NBN7 331 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 NACC1Q96RE7 527 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 UNC45AQ9H3U1 944 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 RABEP2Q9H5N1 569 aa18.46■□□□□ 0.55
ACTB-207ENST00000462494 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
ACTB-207ENST00000462494 TRIM49P0CI25 452 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-207ENST00000462494 TRIM49CP0CI26 452 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-207ENST00000462494 FMO5P49326 533 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-207ENST00000462494 IRAK1P51617 712 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-207ENST00000462494 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP18.45■□□□□ 0.54
ACTB-207ENST00000462494 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
ACTB-207ENST00000462494 MAEAQ7L5Y9 396 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-207ENST00000462494 KCTD17Q8N5Z5 321 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-207ENST00000462494 METTL13Q8N6R0 699 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-207ENST00000462494 BANK1Q8NDB2 785 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-207ENST00000462494 LMBR1Q8WVP7 490 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-207ENST00000462494 PKD2L1Q9P0L9 805 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-207ENST00000462494 DNAJC12Q9UKB3 198 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-207ENST00000462494 CES2O00748 559 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-207ENST00000462494 SOX5P35711 763 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-207ENST00000462494 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
ACTB-207ENST00000462494 SLC15A2Q16348 729 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-207ENST00000462494 CBWD6Q4V339 395 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-207ENST00000462494 CBWD3Q5JTY5 395 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-207ENST00000462494 CBWD5Q5RIA9 395 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-207ENST00000462494 GLYCTKQ8IVS8 523 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-207ENST00000462494 SYCP3Q8IZU3 236 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-207ENST00000462494 SH2D3CQ8N5H7 860 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-207ENST00000462494 EHMT1Q9H9B1 1298 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-207ENST00000462494 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-207ENST00000462494 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
ACTB-207ENST00000462494 TMEM59LQ9UK28 342 aa18.45■□□□□ 0.54
ACTB-207ENST00000462494 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
ACTB-207ENST00000462494 F8VZ95 297 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-207ENST00000462494 ANXA13P27216 316 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-207ENST00000462494 GALCP54803 685 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-207ENST00000462494 GNGT1P63211 74 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-207ENST00000462494 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-207ENST00000462494 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
ACTB-207ENST00000462494 CHURC1Q8WUH1 139 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-207ENST00000462494 CNKSR1Q969H4 720 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-207ENST00000462494 FIZ1Q96SL8 496 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-207ENST00000462494 LXNQ9BS40 222 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-207ENST00000462494 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-207ENST00000462494 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
ACTB-207ENST00000462494 FRMPD4Q14CM0 1322 aa18.44■□□□□ 0.54
ACTB-207ENST00000462494 ANKRD65E5RJM6 399 aa18.43■□□□□ 0.54
ACTB-207ENST00000462494 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
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