RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460176.6

GARNL3-211, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 5

Gene GARNL3, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-211ENST00000460176 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 C22orf31O95567 290 aa11.42□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 STAT6P42226 847 aa11.42□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 SLC12A3P55017 1021 aa11.42□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 UBE2HP62256 183 aa11.42□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 IGBP1P78318 339 aa11.42□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 TRIM60Q495X7 471 aa11.42□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 XKR9Q5GH70 373 aa11.42□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 C1orf53Q5VUE5 145 aa11.42□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 FAM126BQ8IXS8 530 aa11.42□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 ZBTB10Q96DT7 871 aa11.42□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 CEP170P1Q96L14 293 aa11.42□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 BHMT2Q9H2M3 363 aa11.42□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 LMBRD1Q9NUN5 540 aa11.42□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 TANC1Q9C0D5 1861 aa11.41□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 ARHGEF35A5YM69 484 aa11.41□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 TREHO43280 583 aa11.41□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 B4GALT4O60513 344 aa11.41□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 CD4P01730 458 aa11.41□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 PLA2G4BP0C869 781 aa11.41□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 LIG1P18858 919 aa11.41□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 KLRC1P26715 233 aa11.41□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 SYKP43405 635 aa11.41□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 MCM6Q14566 821 aa11.41□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 LRRC26Q2I0M4 334 aa11.41□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 MTHFD1LQ6UB35 978 aa11.41□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa11.41□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 LINC01465Q8N7H1 131 aa11.41□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 IQUBQ8NA54 791 aa11.41□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 ENGASEQ8NFI3 743 aa11.41□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 DHX58Q96C10 678 aa11.41□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 TRPV6Q9H1D0 765 aa11.41□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 TUBE1Q9UJT0 475 aa11.41□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 PPME1Q9Y570 386 aa11.41□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa11.41□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 MROH7Q68CQ1 1323 aa11.4□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 MYH11P35749 1972 aa11.4□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa11.4□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 USO1O60763 962 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 MAFO75444 373 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 GNAT1P11488 350 aa11.4□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 MCM4P33991 863 aa11.4□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 RFC5P40937 340 aa11.4□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 RTP1P59025 263 aa11.4□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 FAM160A1Q05DH4 1040 aa11.4□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 PTGISQ16647 500 aa11.4□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 LONRF3Q496Y0 759 aa11.4□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 RINT1Q6NUQ1 792 aa11.4□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 PADI6Q6TGC4 694 aa11.4□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 RUFY4Q6ZNE9 571 aa11.4□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 SERINC5Q86VE9 423 aa11.4□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 MTRQ99707 1265 aa11.4□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 RUSC1Q9BVN2 902 aa11.4□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 CUEDC2Q9H467 287 aa11.4□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa11.4□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 PDLIM7Q9NR12 457 aa11.4□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 USP25Q9UHP3 1055 aa11.4□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 SERTAD1Q9UHV2 236 aa11.4□□□□□ -0.58
GARNL3-211ENST00000460176 GOLGA6L22H0YM25 854 aa11.39□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 MAGEB2O15479 319 aa11.39□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 NR1I2O75469 434 aa11.39□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 DGAT1O75907 488 aa11.39□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF202O95125 648 aa11.39□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP11.39□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 SLFN14P0C7P3 912 aa11.39□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 CYP2C9P11712 490 aa11.39□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 CYP11B2P19099 503 aa11.39□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 TLE2Q04725 743 aa11.39□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa11.39□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 PTK7Q13308 1070 aa11.39□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 DRP2Q13474 957 aa11.39□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 EMC2Q15006 297 aa11.39□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 ARSHQ5FYA8 562 aa11.39□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 EFCAB12Q6NXP0 572 aa11.39□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 C1orf186Q6ZWK4 172 aa11.39□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 LRRC71Q8N4P6 559 aa11.39□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 FBXO22Q8NEZ5 403 aa11.39□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 SLC7A3Q8WY07 619 aa11.39□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 WNT8BQ93098 351 aa11.39□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 TOX2Q96NM4 488 aa11.39□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 TNMDQ9H2S6 317 aa11.39□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 KBTBD4Q9NVX7 518 aa11.39□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa11.39□□□□□ -0.59
GARNL3-211ENST00000460176 LTBP2Q14767 1821 aa11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms