RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459697.1

RABGGTB-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,177 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-203ENST00000459697 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 SLAMF8Q9P0V8 285 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 ZSWIM5Q9P217 1185 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa6.15□□□□□ -1.42
RABGGTB-203ENST00000459697 MED23Q9ULK4 1368 aa6.15□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 CXCL11O14625 94 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 HMOX1P09601 288 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 RGS2P41220 211 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 ETF1P62495 437 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
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RABGGTB-203ENST00000459697 NKG7Q16617 165 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 MFSD14CQ5VZR4 134 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 PCNX4Q63HM2 1172 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 LETMD1Q6P1Q0 360 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 NLRP10Q86W26 655 aa6.14□□□□□ -1.43
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RABGGTB-203ENST00000459697 FBF1Q8TES7 1133 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 PLPPR2Q96GM1 343 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 OSBPL7Q9BZF2 842 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 COA1Q9GZY4 146 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 KCNK12Q9HB15 430 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 IL23AQ9NPF7 189 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 ITPR1Q14643 2758 aa6.14□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 PRRG2O14669 202 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 GIPC1O14908 333 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 CELA3AP09093 270 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 CYP7A1P22680 504 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 CAP2P40123 477 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 MAPK8P45983 427 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 KCNA10Q16322 511 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 DCAF15Q66K64 600 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 ATG14Q6ZNE5 492 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 TTLL10Q6ZVT0 673 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 HID1Q8IV36 788 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 TMEM105Q8N8V8 129 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 CYP2W1Q8TAV3 490 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 RUBCNQ92622 972 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 APBA2Q99767 749 aa6.13□□□□□ -1.43
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RABGGTB-203ENST00000459697 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 UTYO14607 1347 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 PHIPQ8WWQ0 1821 aa6.13□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 TCAF2A6NFQ2 919 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 B8ZZF3 427 aa6.12□□□□□ -1.43
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RABGGTB-203ENST00000459697 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 CLUL1Q15846 466 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
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RABGGTB-203ENST00000459697 CARD11Q9BXL7 1154 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 ZHX2Q9Y6X8 837 aa6.12□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa6.11□□□□□ -1.43
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RABGGTB-203ENST00000459697 CYP2C18P33260 490 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 KIR3DL1P43629 444 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 RBM25P49756 843 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 HK2P52789 917 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 CACNB3P54284 484 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 TREML2Q5T2D2 321 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 TRPV1Q8NER1 839 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 KCNN1Q92952 543 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 HAUS7Q99871 368 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 RTKNQ9BST9 563 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 FLRT1Q9NZU1 646 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 MTUS1Q9ULD2 1270 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 SRPK3Q9UPE1 567 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa6.11□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 LAMA5O15230 3695 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 A0A1W2PQY0 241 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 TRIM75PA6NK02 468 aa6.1□□□□□ -1.43
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RABGGTB-203ENST00000459697 PEX10O60683 326 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 MED14OSP0DP75 135 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 CYP2C19P33261 490 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 IL13P35225 146 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 ERVFC1P60507 584 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 TNK2Q07912 1038 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 RALGPS1Q5JS13 557 aa6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
RABGGTB-203ENST00000459697 ALG1LQ6GMV1 187 aa6.1□□□□□ -1.43
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