RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453996.6

CTU2-202, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTU2, Length 1,751 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-202ENST00000453996 TC2NQ8N9U0 490 aa23.52■■□□□ 1.36
CTU2-202ENST00000453996 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CTU2-202ENST00000453996 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP23.52■■□□□ 1.36
CTU2-202ENST00000453996 MARSP56192 900 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
CTU2-202ENST00000453996 KCNA1Q09470 495 aa23.52■■□□□ 1.36
CTU2-202ENST00000453996 VWA3BQ502W6 1294 aa23.52■■□□□ 1.36
CTU2-202ENST00000453996 FKBP15Q5T1M5 1219 aa23.52■■□□□ 1.36
CTU2-202ENST00000453996 FAM102BQ5T8I3 360 aa23.52■■□□□ 1.36
CTU2-202ENST00000453996 FAM160B1Q5W0V3 765 aa23.52■■□□□ 1.36
CTU2-202ENST00000453996 CEP135Q66GS9 1140 aa23.52■■□□□ 1.36
CTU2-202ENST00000453996 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
CTU2-202ENST00000453996 CYP26B1Q9NR63 512 aa23.52■■□□□ 1.36
CTU2-202ENST00000453996 PPP1R37O75864 691 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 OATP04181 439 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 GYPCP04921 128 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 SLC10A3P09131 477 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 ADKP55263 362 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 RBL2Q08999 1139 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 GRB14Q14449 540 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP23.51■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 PLEKHH3Q7Z736 793 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 SEPT1Q8WYJ6 367 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 STRA6Q9BX79 667 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 ADGRA2Q96PE1 1338 aa23.51■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 DGAT1O75907 488 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 NR3C1P04150 777 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 RPL13P26373 211 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 TTLL4Q14679 1199 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 CCDC62Q6P9F0 684 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 SLC17A8Q8NDX2 589 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 MCPH1Q8NEM0 835 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 SCFD2Q8WU76 684 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 KIFAP3Q92845 792 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 TMX1Q9H3N1 280 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 NDST4Q9H3R1 872 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 GPRC5CQ9NQ84 441 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 SPTLC3Q9NUV7 552 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 TGFB1I1O43294 461 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 MFAP3LO75121 409 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 ATP4AP20648 1035 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 CNGA4Q8IV77 575 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 AFAP1L1Q8TED9 768 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 VTA1Q9NP79 307 aa23.5■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 TXNP10599 105 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 CASP14P31944 242 aa23.49■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 NFIL3Q16649 462 aa23.49■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 HS2ST1Q7LGA3 356 aa23.49■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 DPP9Q86TI2 863 aa23.49■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 CPLX3Q8WVH0 158 aa23.49■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 PANX2Q96RD6 677 aa23.49■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 ERGIC2Q96RQ1 377 aa23.49■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 PCYT2Q99447 389 aa23.49■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa23.49■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa23.49■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 CPA4Q9UI42 421 aa23.49■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 TLL2Q9Y6L7 1015 aa23.49■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 NOP56O00567 594 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 STAT5BP51692 787 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 NCKAP1LP55160 1127 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 PEX3P56589 373 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 MTERF2Q49AM1 385 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 KSR1Q8IVT5 923 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 GOLGA5Q8TBA6 731 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 GPR20Q99678 358 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 GBP3Q9H0R5 595 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 C17orf75Q9HAS0 396 aa23.48■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 KCNJ6P48051 423 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP23.47■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 SYCP1Q15431 976 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 TRIM59Q8IWR1 403 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 CCDC51Q96ER9 411 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 AZI2Q9H6S1 392 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 PDLIM7Q9NR12 457 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 PDGFCQ9NRA1 345 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 SLC15A5A6NIM6 579 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 INHBEP58166 350 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 FRMD5Q7Z6J6 570 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 TMEM139Q8IV31 216 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 SYCP3Q8IZU3 236 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 SPATA33Q96N06 139 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 ACCSQ96QU6 501 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 TMEM206Q9H813 350 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 NRBP2Q9NSY0 501 aa23.47■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 CLIC2O15247 247 aa23.46■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 SMTNP53814 917 aa23.46■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CTU2-202ENST00000453996 RTP1P59025 263 aa23.46■■□□□ 1.35
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