RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449757.5

DDX39B-211, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 3

Gene DDX39B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-211ENST00000449757 AKT3Q9Y243 479 aa11.71□□□□□ -0.53
DDX39B-211ENST00000449757 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 SREBF1P36956 1147 aa11.7□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 PBX3P40426 434 aa11.7□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 VCPP55072 806 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 AP3B2Q13367 1082 aa11.7□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF484Q5JVG2 852 aa11.7□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa11.7□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 SWSAP1Q6NVH7 229 aa11.7□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 APOA5Q6Q788 366 aa11.7□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 ABHD15Q6UXT9 468 aa11.7□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa11.7□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa11.7□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 LRRC43Q8N309 656 aa11.7□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 TCEANC2Q96MN5 208 aa11.7□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 MAP7D2Q96T17 732 aa11.7□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM161AQ9NX61 479 aa11.7□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 SAMM50Q9Y512 469 aa11.7□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 USP34Q70CQ2 3546 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 C9IYK1 514 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 hCG_1984214I3L0E3 225 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 MEIS1O00470 390 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 FSCN2O14926 492 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 ZBTB43O43298 467 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 HOXA2O43364 376 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 ATG7O95352 703 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 C22orf31O95567 290 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 CLCN3P51790 818 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 TCF15Q12870 199 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 PTPN21Q16825 1174 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 ANKRD54Q6NXT1 300 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 SGMS1Q86VZ5 419 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 SUSD6Q92537 303 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF558Q96NG5 402 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 ZNF577Q9BSK1 485 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM117Q9H0C3 514 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 GLT8D2Q9H1C3 349 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 CWH43Q9H720 699 aa11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 V9GY48 417 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 HIDE1A8MVS5 230 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 FAM86B1E9PN63 330 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 GFRA3O60609 400 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 PSAPP07602 524 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 FAM86B2P0C5J1 330 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 PPM1AP35813 382 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 FGD1P98174 961 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 SETQ01105 290 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 KRT17Q04695 432 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 RNF20Q5VTR2 975 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 NIPA1Q7RTP0 329 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 TMC7Q7Z402 723 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 LRRC71Q8N4P6 559 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 TMEM87AQ8NBN3 555 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 BARHL2Q9NY43 387 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 GABBR1Q9UBS5 961 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 CDH22Q9UJ99 828 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 LZTS1Q9Y250 596 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 NR2E1Q9Y466 385 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 PLXNA3P51805 1871 aa11.68□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 ZBTB42B2RXF5 422 aa11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 ST18O60284 1047 aa11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 GPR32O75388 356 aa11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 TPRNQ4KMQ1 711 aa11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 KCNT2Q6UVM3 1135 aa11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 CASP10Q92851 521 aa11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 ASIC4Q96FT7 647 aa11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 CASD1Q96PB1 797 aa11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 BRPF3Q9ULD4 1205 aa11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 CEP131Q9UPN4 1083 aa11.67□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 SPDYE4A6NLX3 237 aa11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 CHMP2AO43633 222 aa11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 ATP4AP20648 1035 aa11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 FGFR4P22455 802 aa11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 TMOD1P28289 359 aa11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 AVPR2P30518 371 aa11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 CLK2P49760 499 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 PLCB3Q01970 1234 aa11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 MTMR3Q13615 1198 aa11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 DSC3Q14574 896 aa11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
DDX39B-211ENST00000449757 NECTIN1Q15223 517 aa11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms