RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435020.1

RPS28P8-201, Transcript of ribosomal protein S28 pseudogene 8, humanhuman

BASIC

Gene RPS28P8, Length 208 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P8-201ENST00000435020 DOCK8Q8NF50 2099 aa9.6□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 FSCN2O14926 492 aa9.6□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 PSMD10O75832 226 aa9.6□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 EYA4O95677 639 aa9.6□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 CLCN3P51790 818 aa9.6□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 PAK2Q13177 524 aa9.6□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 KIZQ2M2Z5 673 aa9.6□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 PRR16Q569H4 304 aa9.6□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 PDXDC2PQ6P474 469 aa9.6□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa9.6□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 OSMRQ99650 979 aa9.6□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 ADAM2Q99965 735 aa9.6□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 ZNF577Q9BSK1 485 aa9.6□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 TBC1D22BQ9NU19 505 aa9.6□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 RWDD3Q9Y3V2 267 aa9.6□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa9.6□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 PLXNA3P51805 1871 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 TRIP11Q15643 1979 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 DCHS1Q96JQ0 3298 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 SPTBN4Q9H254 2564 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 TMEM150BA6NC51 233 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 BACH1O14867 736 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 DTNBO60941 627 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 RPS6KA5O75582 802 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 TDP2O95551 362 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 CYP3A7P24462 503 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 ERVFC1P60507 584 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 SETQ01105 290 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 CLUL1Q15846 466 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 NAALADL2Q58DX5 795 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 TMEM31Q5JXX7 168 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 FAM160B1Q5W0V3 765 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 ADHFE1Q8IWW8 467 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 EFHBQ8N7U6 833 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 SMRP1Q8NCR6 262 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 ETNPPLQ8TBG4 499 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 POF1BQ8WVV4 589 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 CASD1Q96PB1 797 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 PPP1R16BQ96T49 567 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 UNC45AQ9H3U1 944 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 C6orf50Q9HD87 102 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 GABBR1Q9UBS5 961 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 PRKAG3Q9UGI9 489 aa9.59□□□□□ -0.87
RPS28P8-201ENST00000435020 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 PRR33A8MZF0 331 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 FGFR1P11362 822 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 ZNF76P36508 570 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 GPC3P51654 580 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 USP11P51784 963 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 CCT2P78371 535 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 PRKCEQ02156 737 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 COASYQ13057 564 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 Q4G0T1 1027 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 CLLU1OSQ5K130 101 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 SLC24A5Q71RS6 500 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 RUFY3Q7L099 469 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 LRRC71Q8N4P6 559 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 DAGLBQ8NCG7 672 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 SUSD6Q92537 303 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 RIT2Q99578 217 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 SLC26A6Q9BXS9 759 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 SH3GLB2Q9NR46 395 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 DISC1Q9NRI5 854 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 TMEM161AQ9NX61 479 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 ZNF292O60281 2723 aa9.58□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 WDR64B1ANS9 1081 aa9.57□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 LOC730098B7Z3J9 87 aa9.57□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 EML1O00423 815 aa9.57□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 NCK2O43639 380 aa9.57□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 SLC37A4O43826 429 aa9.57□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 B4GALT3O60512 393 aa9.57□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 CSPG5O95196 566 aa9.57□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 CTDNEP1O95476 244 aa9.57□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 OATP04181 439 aa9.57□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 PSAPP07602 524 aa9.57□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 STAG3L1P0CL83 205 aa9.57□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 GNA11P29992 359 aa9.57□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
RPS28P8-201ENST00000435020 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms