RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430978.6

LINC00454-202, long intergenic non-protein coding RNA 454, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC00454, Length 1,327 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00454-202ENST00000430978 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
LINC00454-202ENST00000430978 ERVK-21P61565 698 aa24.47■■□□□ 1.51
LINC00454-202ENST00000430978 IL27Q8NEV9 243 aa24.47■■□□□ 1.51
LINC00454-202ENST00000430978 SH2D3AQ9BRG2 576 aa24.47■■□□□ 1.51
LINC00454-202ENST00000430978 PCDHA12Q9UN75 941 aa24.47■■□□□ 1.51
LINC00454-202ENST00000430978 TMEM150BA6NC51 233 aa24.46■■□□□ 1.51
LINC00454-202ENST00000430978 GPR182O15218 404 aa24.46■■□□□ 1.51
LINC00454-202ENST00000430978 NEMFO60524 1076 aa24.46■■□□□ 1.51
LINC00454-202ENST00000430978 EPHA7Q15375 998 aa24.46■■□□□ 1.51
LINC00454-202ENST00000430978 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
LINC00454-202ENST00000430978 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa24.46■■□□□ 1.51
LINC00454-202ENST00000430978 SCLT1Q96NL6 688 aa24.46■■□□□ 1.51
LINC00454-202ENST00000430978 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa24.46■■□□□ 1.51
LINC00454-202ENST00000430978 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
LINC00454-202ENST00000430978 NLRC5Q86WI3 1866 aa24.46■■□□□ 1.51
LINC00454-202ENST00000430978 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa24.45■■□□□ 1.51
LINC00454-202ENST00000430978 GPR32O75388 356 aa24.45■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 STBD1O95210 358 aa24.45■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 DNM2P50570 870 aa24.45■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 ZNF710Q8N1W2 664 aa24.45■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 TMEM40Q8WWA1 233 aa24.45■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 ERVK-5Q9HDB9 667 aa24.45■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 DENND3A2RUS2 1198 aa24.44■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 TXKP42681 527 aa24.44■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 GRB10Q13322 594 aa24.44■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 ANO5Q75V66 913 aa24.44■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 LINC01465Q8N7H1 131 aa24.44■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 GDPD5Q8WTR4 605 aa24.44■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 LINC01599Q8WXQ3 324 aa24.44■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 C17orf80Q9BSJ5 609 aa24.44■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 TMX1Q9H3N1 280 aa24.44■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 MTCH2Q9Y6C9 303 aa24.44■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 STAG3L1P0CL83 205 aa24.43■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 MCM7P33993 719 aa24.43■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 PLA2G4FQ68DD2 849 aa24.43■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 FIBCD1Q8N539 461 aa24.43■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 FBXO22Q8NEZ5 403 aa24.43■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 DYDC2Q96IM9 177 aa24.43■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 TBC1D32Q96NH3 1257 aa24.43■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 LXNQ9BS40 222 aa24.43■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 RGL1Q9NZL6 768 aa24.43■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 LRFN2Q9ULH4 789 aa24.43■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 KIF3AQ9Y496 699 aa24.43■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 WNT7AO00755 349 aa24.42■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 CYP4A11Q02928 519 aa24.42■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 OTUD6AQ7L8S5 288 aa24.42■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 FAM228AQ86W67 206 aa24.42■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 NPAS4Q8IUM7 802 aa24.42■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 TPH2Q8IWU9 490 aa24.42■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 NLRP7Q8WX94 980 aa24.42■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 SAMD11Q96NU1 681 aa24.42■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 ADAM2Q99965 735 aa24.42■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 ADAMTS10Q9H324 1103 aa24.42■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 CYP26B1Q9NR63 512 aa24.42■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa24.41■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 MCM2P49736 904 aa24.41■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 GPC3P51654 580 aa24.41■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 CDC42EP1Q00587 391 aa24.41■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 SPIRE1Q08AE8 756 aa24.41■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 C4orf19Q8IY42 314 aa24.41■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 TMX3Q96JJ7 454 aa24.41■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 CEP170P1Q96L14 293 aa24.41■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa24.41■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 UNC80Q8N2C7 3258 aa24.41■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 MAFO75444 373 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 DGKIO75912 1065 aa24.4■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 YWHABP31946 246 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 NPEPPSP55786 919 aa24.4■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 DRP2Q13474 957 aa24.4■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 EPC2Q52LR7 807 aa24.4■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 NOSTRINQ8IVI9 506 aa24.4■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 TMEM192Q8IY95 271 aa24.4■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 EXOC8Q8IYI6 725 aa24.4■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 SLC7A3Q8WY07 619 aa24.4■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 MTMR9Q96QG7 549 aa24.4■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 CEP89Q96ST8 783 aa24.4■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 C1orf112Q9NSG2 853 aa24.4■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa24.4■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa24.4■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 A0A0C4DFX4 3053 aa24.4■■□□□ 1.5
LINC00454-202ENST00000430978 MGEA5O60502 916 aa24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms