RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428534.1

GLI3-202, Transcript of GLI family zinc finger 3, humanhuman

TSL 4

Gene GLI3, Length 583 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3-202ENST00000428534 STK38Q15208 465 aa26.16■■□□□ 1.78
GLI3-202ENST00000428534 PTPAQ15257 358 aa26.16■■□□□ 1.78
GLI3-202ENST00000428534 TRAF7Q6Q0C0 670 aa26.16■■□□□ 1.78
GLI3-202ENST00000428534 TCP11Q8WWU5 503 aa26.16■■□□□ 1.78
GLI3-202ENST00000428534 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa26.16■■□□□ 1.78
GLI3-202ENST00000428534 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
GLI3-202ENST00000428534 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
GLI3-202ENST00000428534 DGAT1O75907 488 aa26.15■■□□□ 1.78
GLI3-202ENST00000428534 YEATS4O95619 227 aa26.15■■□□□ 1.78
GLI3-202ENST00000428534 CTSHP09668 335 aa26.15■■□□□ 1.78
GLI3-202ENST00000428534 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
GLI3-202ENST00000428534 TMEM240Q5SV17 173 aa26.15■■□□□ 1.78
GLI3-202ENST00000428534 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
GLI3-202ENST00000428534 PLA2G4FQ68DD2 849 aa26.15■■□□□ 1.78
GLI3-202ENST00000428534 DEFB128Q7Z7B8 93 aa26.15■■□□□ 1.78
GLI3-202ENST00000428534 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
GLI3-202ENST00000428534 APBB2Q92870 758 aa26.15■■□□□ 1.78
GLI3-202ENST00000428534 CALML4Q96GE6 196 aa26.15■■□□□ 1.78
GLI3-202ENST00000428534 CEP89Q96ST8 783 aa26.15■■□□□ 1.78
GLI3-202ENST00000428534 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
GLI3-202ENST00000428534 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
GLI3-202ENST00000428534 DNM3Q9UQ16 869 aa26.15■■□□□ 1.78
GLI3-202ENST00000428534 AKT3Q9Y243 479 aa26.15■■□□□ 1.78
GLI3-202ENST00000428534 CDY2AQ9Y6F7 541 aa26.15■■□□□ 1.78
GLI3-202ENST00000428534 DLL1O00548 723 aa26.14■■□□□ 1.78
GLI3-202ENST00000428534 PPP6R2O75170 966 aa26.14■■□□□ 1.78
GLI3-202ENST00000428534 BAIAP3O94812 1187 aa26.14■■□□□ 1.78
GLI3-202ENST00000428534 CHRNA1P02708 482 aa26.14■■□□□ 1.78
GLI3-202ENST00000428534 RARRES1P49788 294 aa26.14■■□□□ 1.78
GLI3-202ENST00000428534 NPEPPSP55786 919 aa26.14■■□□□ 1.78
GLI3-202ENST00000428534 MGAT3Q09327 533 aa26.14■■□□□ 1.78
GLI3-202ENST00000428534 CNKSR3Q6P9H4 555 aa26.14■■□□□ 1.78
GLI3-202ENST00000428534 ZNF365Q70YC5 407 aa26.14■■□□□ 1.78
GLI3-202ENST00000428534 LINC01465Q8N7H1 131 aa26.14■■□□□ 1.78
GLI3-202ENST00000428534 KIAA1024Q9UPX6 916 aa26.14■■□□□ 1.78
GLI3-202ENST00000428534 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa26.14■■□□□ 1.78
GLI3-202ENST00000428534 ASAP2O43150 1006 aa26.13■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 ACRP10323 421 aa26.13■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 TXLNAP40222 546 aa26.13■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 HYIQ5T013 277 aa26.13■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 LINC00301Q8NCQ3 95 aa26.13■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 PIGOQ8TEQ8 1089 aa26.13■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 HERVK_113Q902F9 699 aa26.13■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 SEPT8Q92599 483 aa26.13■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 MTRQ99707 1265 aa26.13■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP26.13■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 TANC1Q9C0D5 1861 aa26.13■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 CDH23Q9H251 3354 aa26.12■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 TMEM150BA6NC51 233 aa26.12■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 SPTLC2O15270 562 aa26.12■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 NBNO60934 754 aa26.12■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 CLCN3P51790 818 aa26.12■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 PKP1Q13835 747 aa26.12■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 POTEGQ6S5H5 508 aa26.12■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 C16orf59Q7L2K0 433 aa26.12■■□□□ 1.77
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GLI3-202ENST00000428534 LRRC71Q8N4P6 559 aa26.12■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 KCNG4Q8TDN1 519 aa26.12■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 ZBTB10Q96DT7 871 aa26.12■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa26.12■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 ARHGEF35A5YM69 484 aa26.11■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 EPHB4P54760 987 aa26.11■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 IKBKEQ14164 716 aa26.11■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 SHHQ15465 462 aa26.11■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa26.11■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa26.11■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 MCPH1Q8NEM0 835 aa26.11■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 SH2D3AQ9BRG2 576 aa26.11■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 CCDC39Q9UFE4 941 aa26.11■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa26.1■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 ZBTB39O15060 712 aa26.1■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 EMC2Q15006 297 aa26.1■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 FBXO47Q5MNV8 452 aa26.1■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 ZNF410Q86VK4 478 aa26.1■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 RASSF8Q8NHQ8 419 aa26.1■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 CCSER1Q9C0I3 900 aa26.1■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 PP2D1A8MPX8 630 aa26.09■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 EYA4O95677 639 aa26.09■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 VTNP04004 478 aa26.09■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 CDC25AP30304 524 aa26.09■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 KRT85P78386 507 aa26.09■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 TMEM62Q0P6H9 643 aa26.09■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 MBTPS1Q14703 1052 aa26.09■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 GPNMBQ14956 572 aa26.09■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 SCLT1Q96NL6 688 aa26.09■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 FTHL17Q9BXU8 183 aa26.09■■□□□ 1.77
GLI3-202ENST00000428534 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
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