RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 PPATQ06203 517 aa25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 NCAPG2Q86XI2 1143 aa25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 CHST13Q8NET6 341 aa25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 SLC35C1Q96A29 364 aa25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 CARD6Q9BX69 1037 aa25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
FAAP20-209ENST00000428120 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 TISP43B9A030 160 aa25.45■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 PPP1R37O75864 691 aa25.45■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 UBE4BO95155 1302 aa25.45■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 SLC9A1P19634 815 aa25.45■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 NF2P35240 595 aa25.45■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 ELF2Q15723 593 aa25.45■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 ERO1BQ86YB8 467 aa25.45■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 FAM186BQ8IYM0 893 aa25.45■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 LACRTQ9GZZ8 138 aa25.45■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF862O60290 1169 aa25.45■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC122Q5T0U0 273 aa25.45■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 FAM102BQ5T8I3 360 aa25.45■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 SWSAP1Q6NVH7 229 aa25.45■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 ANKRD7Q92527 254 aa25.45■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 STRA6Q9BX79 667 aa25.45■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 DEF6Q9H4E7 631 aa25.45■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 PLS3P13797 630 aa25.44■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 SP2Q02086 613 aa25.44■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 GNPTABQ3T906 1256 aa25.44■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 KIF11P52732 1056 aa25.43■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 SOX10P56693 466 aa25.43■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 SPATC1LQ9H0A9 340 aa25.43■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 SLC9A2Q9UBY0 812 aa25.43■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 MRFAP1Q9Y605 127 aa25.43■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 WDR81Q562E7 1941 aa25.43■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 PEX3P56589 373 aa25.43■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 ARID5AQ03989 594 aa25.43■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa25.43■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 SEPT14Q6ZU15 432 aa25.43■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 JAKMIP2Q96AA8 810 aa25.43■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 BORCS6Q96GS4 357 aa25.43■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 SENP7Q9BQF6 1050 aa25.43■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 EDEM3Q9BZQ6 932 aa25.43■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 GANQ9H2C0 597 aa25.43■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 DUSP10Q9Y6W6 482 aa25.43■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa25.42■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 TLR2O60603 784 aa25.42■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 ACTR2P61160 394 aa25.42■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 STXBP2Q15833 593 aa25.42■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 RIOX2Q8IUF8 465 aa25.42■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 RDH13Q8NBN7 331 aa25.42■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 MNS1Q8NEH6 495 aa25.42■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 CDHR1Q96JP9 859 aa25.42■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 HAUS4Q9H6D7 363 aa25.42■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 SPDYE5A6NIY4 337 aa25.42■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 SLC16A4O15374 487 aa25.42■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 RAPGEF1Q13905 1077 aa25.42■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 EXOC3L4Q17RC7 722 aa25.42■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 RDM1Q8NG50 284 aa25.42■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 ANKEF1Q9NU02 776 aa25.42■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 AKR1B10O60218 316 aa25.41■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 SPA17Q15506 151 aa25.41■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 SFMBT2Q5VUG0 894 aa25.41■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 HGSNATQ68CP4 663 aa25.41■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 CYFIP1Q7L576 1253 aa25.41■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 OPTNQ96CV9 577 aa25.41■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 DRC1Q96MC2 740 aa25.41■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 PCIF1Q9H4Z3 704 aa25.41■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 LOC285556D6RIA3 1793 aa25.41■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 CTAGE9A4FU28 777 aa25.41■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 PON1P27169 355 aa25.41■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 PPP2R3AQ06190 1150 aa25.41■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 NFIL3Q16649 462 aa25.41■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 HAUS6Q7Z4H7 955 aa25.41■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 CEP170P1Q96L14 293 aa25.41■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 IWS1Q96ST2 819 aa25.41■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 KIFC3Q9BVG8 833 aa25.41■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa25.41■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 STAM2O75886 525 aa25.4■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 PSAPP07602 524 aa25.4■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 DNERQ8NFT8 737 aa25.4■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 ATP6V0A1Q93050 837 aa25.4■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 DMAC2Q9NW81 257 aa25.4■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 PFASO15067 1338 aa25.4■■□□□ 1.66
FAAP20-209ENST00000428120 NFASCO94856 1347 aa25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms