RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427196.1

HCG25-218, Transcript of HLA complex group 25, humanhuman

TSL 2

Gene HCG25, Length 677 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG25-218ENST00000427196 SLC9A2Q9UBY0 812 aa7.4□□□□□ -1.22
HCG25-218ENST00000427196 VAV3Q9UKW4 847 aa7.4□□□□□ -1.22
HCG25-218ENST00000427196 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
HCG25-218ENST00000427196 PCDHA12Q9UN75 941 aa7.4□□□□□ -1.22
HCG25-218ENST00000427196 Q9Y3F1 56 aa7.4□□□□□ -1.22
HCG25-218ENST00000427196 NFASCO94856 1347 aa7.4□□□□□ -1.22
HCG25-218ENST00000427196 MROH7Q68CQ1 1323 aa7.4□□□□□ -1.22
HCG25-218ENST00000427196 ELP1O95163 1332 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 EML1O00423 815 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 NOP56O00567 594 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 MMP3P08254 477 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 MYL3P08590 195 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 TECP42680 631 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 CDK7P50613 346 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 NKX3-2P78367 333 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 GRIN1Q05586 938 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 SPIRE1Q08AE8 756 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 STK38Q15208 465 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 B3GNT9Q6UX72 402 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 SLFN12Q8IYM2 578 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 VTI1AQ96AJ9 217 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 TEKT3Q9BXF9 490 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 SUGCTQ9HAC7 445 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 POLR3EQ9NVU0 708 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 FANCMQ8IYD8 2048 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 SPEGQ15772 3267 aa7.39□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 FRYQ5TBA9 3013 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 VWA3AA6NCI4 1184 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 POTEMA6NI47 508 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 PP2D1A8MPX8 630 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 LAD1O00515 517 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 TLR3O15455 904 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 PPFIA4O75335 1185 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 ATG7O95352 703 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 CD4P01730 458 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 LGALS2P05162 132 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 ASGR1P07306 291 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 ZNF286BP0CG31 522 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 NCLP19338 710 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 PRPHP41219 470 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 NASPP49321 788 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 CPT1AP50416 773 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 KRT76Q01546 638 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 SIGLEC14Q08ET2 396 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 PPP2R5CQ13362 524 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 SLC39A14Q15043 492 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 NCAPH2Q6IBW4 605 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 CXCL17Q6UXB2 119 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 ABHD15Q6UXT9 468 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 DTHD1Q6ZMT9 781 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 MIER3Q7Z3K6 550 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 TRIM50Q86XT4 487 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 HERC6Q8IVU3 1022 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 TMEM105Q8N8V8 129 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 LINC00301Q8NCQ3 95 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 PPTC7Q8NI37 304 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 SEPT1Q8WYJ6 367 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 CLIC6Q96NY7 704 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 PCYT2Q99447 389 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 HINFPQ9BQA5 517 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 C16orf70Q9BSU1 422 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 SPC25Q9HBM1 224 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 GDPD2Q9HCC8 539 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 DISC1Q9NRI5 854 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 CLDND1Q9NY35 253 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 DLL3Q9NYJ7 618 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 RCOR1Q9UKL0 485 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 CEP131Q9UPN4 1083 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 SAMM50Q9Y512 469 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 MICAL3Q7RTP6 2002 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 EVPLQ92817 2033 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 ARID2Q68CP9 1835 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 WDR64B1ANS9 1081 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 ARVCFO00192 962 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 SPTLC2O15270 562 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 LGR5O75473 907 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 CSPG5O95196 566 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 YEATS4O95619 227 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 BMP15O95972 392 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 PSAPP07602 524 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG25-218ENST00000427196 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa7.37□□□□□ -1.23
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