RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 PLAGL2Q9UPG8 496 aa23.53■■□□□ 1.36
UBXN4-204ENST00000426921 MYO7AQ13402 2215 aa23.53■■□□□ 1.36
UBXN4-204ENST00000426921 GRXCR2A6NFK2 248 aa23.52■■□□□ 1.36
UBXN4-204ENST00000426921 C9IYK1 514 aa23.52■■□□□ 1.36
UBXN4-204ENST00000426921 VTNP04004 478 aa23.52■■□□□ 1.36
UBXN4-204ENST00000426921 CLCN3P51790 818 aa23.52■■□□□ 1.36
UBXN4-204ENST00000426921 UGCGQ16739 394 aa23.52■■□□□ 1.36
UBXN4-204ENST00000426921 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
UBXN4-204ENST00000426921 SLC24A5Q71RS6 500 aa23.52■■□□□ 1.36
UBXN4-204ENST00000426921 FAM178BQ8IXR5 827 aa23.52■■□□□ 1.36
UBXN4-204ENST00000426921 METTL13Q8N6R0 699 aa23.52■■□□□ 1.36
UBXN4-204ENST00000426921 ADAM2Q99965 735 aa23.52■■□□□ 1.36
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UBXN4-204ENST00000426921 TDP2O95551 362 aa23.51■■□□□ 1.35
UBXN4-204ENST00000426921 NEFLP07196 543 aa23.51■■□□□ 1.35
UBXN4-204ENST00000426921 DSC3Q14574 896 aa23.51■■□□□ 1.35
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UBXN4-204ENST00000426921 AIFM3Q96NN9 605 aa23.51■■□□□ 1.35
UBXN4-204ENST00000426921 MAP7D2Q96T17 732 aa23.51■■□□□ 1.35
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UBXN4-204ENST00000426921 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa23.51■■□□□ 1.35
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UBXN4-204ENST00000426921 ITGB1P05556 798 aa23.5■■□□□ 1.35
UBXN4-204ENST00000426921 IL9P15248 144 aa23.5■■□□□ 1.35
UBXN4-204ENST00000426921 TMOD1P28289 359 aa23.5■■□□□ 1.35
UBXN4-204ENST00000426921 LTBRP36941 435 aa23.5■■□□□ 1.35
UBXN4-204ENST00000426921 GATMP50440 423 aa23.5■■□□□ 1.35
UBXN4-204ENST00000426921 HYAL1Q12794 435 aa23.5■■□□□ 1.35
UBXN4-204ENST00000426921 STK3Q13188 491 aa23.5■■□□□ 1.35
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UBXN4-204ENST00000426921 PPP1R16BQ96T49 567 aa23.5■■□□□ 1.35
UBXN4-204ENST00000426921 ADAMTS10Q9H324 1103 aa23.5■■□□□ 1.35
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UBXN4-204ENST00000426921 CD320Q9NPF0 282 aa23.5■■□□□ 1.35
UBXN4-204ENST00000426921 STK36Q9NRP7 1315 aa23.5■■□□□ 1.35
UBXN4-204ENST00000426921 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
UBXN4-204ENST00000426921 CHMP2AO43633 222 aa23.49■■□□□ 1.35
UBXN4-204ENST00000426921 CDKL5O76039 1030 aa23.49■■□□□ 1.35
UBXN4-204ENST00000426921 COL9A1P20849 921 aa23.49■■□□□ 1.35
UBXN4-204ENST00000426921 FAM189BP81408 668 aa23.49■■□□□ 1.35
UBXN4-204ENST00000426921 SCRN1Q12765 414 aa23.49■■□□□ 1.35
UBXN4-204ENST00000426921 SPPL3Q8TCT6 385 aa23.49■■□□□ 1.35
UBXN4-204ENST00000426921 GJA10Q969M2 543 aa23.49■■□□□ 1.35
UBXN4-204ENST00000426921 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM161AQ9NX61 479 aa23.49■■□□□ 1.35
UBXN4-204ENST00000426921 CLDND1Q9NY35 253 aa23.49■■□□□ 1.35
UBXN4-204ENST00000426921 AKT3Q9Y243 479 aa23.49■■□□□ 1.35
UBXN4-204ENST00000426921 DNAJB1P25685 340 aa23.48■■□□□ 1.35
UBXN4-204ENST00000426921 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
UBXN4-204ENST00000426921 ANAPC15P60006 121 aa23.48■■□□□ 1.35
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UBXN4-204ENST00000426921 LRRC71Q8N4P6 559 aa23.48■■□□□ 1.35
UBXN4-204ENST00000426921 KLHL23Q8NBE8 558 aa23.48■■□□□ 1.35
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UBXN4-204ENST00000426921 MIER3Q7Z3K6 550 aa23.47■■□□□ 1.35
UBXN4-204ENST00000426921 CEP89Q96ST8 783 aa23.47■■□□□ 1.35
UBXN4-204ENST00000426921 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
UBXN4-204ENST00000426921 EPHX3Q9H6B9 360 aa23.47■■□□□ 1.35
UBXN4-204ENST00000426921 FAM50BQ9Y247 325 aa23.47■■□□□ 1.35
UBXN4-204ENST00000426921 PFKFB2O60825 505 aa23.46■■□□□ 1.35
UBXN4-204ENST00000426921 STBD1O95210 358 aa23.46■■□□□ 1.35
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UBXN4-204ENST00000426921 XKR3Q5GH77 459 aa23.46■■□□□ 1.35
UBXN4-204ENST00000426921 FAM102BQ5T8I3 360 aa23.46■■□□□ 1.35
UBXN4-204ENST00000426921 GJD3Q8N144 294 aa23.46■■□□□ 1.35
UBXN4-204ENST00000426921 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
UBXN4-204ENST00000426921 TPCN1Q9ULQ1 816 aa23.46■■□□□ 1.35
UBXN4-204ENST00000426921 KCNJ14Q9UNX9 436 aa23.46■■□□□ 1.35
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UBXN4-204ENST00000426921 TBKBP1A7MCY6 615 aa23.45■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 SLC37A4O43826 429 aa23.45■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 DARSP14868 501 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 UBE3AQ05086 875 aa23.45■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 INF2Q27J81 1249 aa23.45■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 POF1BQ8WVV4 589 aa23.45■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 PPP2R3CQ969Q6 453 aa23.45■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa23.45■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 PRKAG3Q9UGI9 489 aa23.45■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 PI4K2BG5E9Z4 385 aa23.44■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 TBX10O75333 385 aa23.44■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 IRS1P35568 1242 aa23.44■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 PPP4R3AQ6IN85 833 aa23.44■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 EP400NLQ6ZTU2 488 aa23.44■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 KCNMB3Q9NPA1 279 aa23.44■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 AAASQ9NRG9 546 aa23.44■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 PPP4R2Q9NY27 417 aa23.44■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa23.44■■□□□ 1.34
UBXN4-204ENST00000426921 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa23.44■■□□□ 1.34
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