RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 GUCD1Q96NT3 240 aa28.01■■■□□ 2.07
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HTATSF1-202ENST00000425695 CEP170P1Q96L14 293 aa28■■■□□ 2.07
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HTATSF1-202ENST00000425695 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP27.91■■■□□ 2.061e-6■■■■□ 26.5
HTATSF1-202ENST00000425695 SPRED2Q7Z698 418 aa27.91■■■□□ 2.06
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HTATSF1-202ENST00000425695 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa27.91■■■□□ 2.06
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