RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PER2O15055 1255 aa14.95□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBM10P98175 930 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SETQ01105 290 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIZQ2M2Z5 673 aa14.95□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa14.95□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SWSAP1Q6NVH7 229 aa14.95□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VN1R2Q8NFZ6 395 aa14.95□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CRYGNQ8WXF5 182 aa14.95□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa14.95□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM161AQ9NX61 479 aa14.95□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KMT2EQ8IZD2 1858 aa14.95□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa14.95□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FSCN2O14926 492 aa14.95□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VTNP04004 478 aa14.95□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYP3A4P08684 503 aa14.95□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FGFR1P11362 822 aa14.95□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LAG3P18627 525 aa14.95□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDC27P30260 824 aa14.95□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RCAN1P53805 252 aa14.95□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERVFC1P60507 584 aa14.95□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZXDAP98168 799 aa14.95□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CKAP2LQ8IYA6 745 aa14.95□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SUSD6Q92537 303 aa14.95□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PBXIP1Q96AQ6 731 aa14.95□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF577Q9BSK1 485 aa14.95□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CWH43Q9H720 699 aa14.95□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TBC1D22BQ9NU19 505 aa14.95□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WDR81Q562E7 1941 aa14.94□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR32O75388 356 aa14.94□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SRGAP2BP0DMP2 458 aa14.94□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DSC3Q14574 896 aa14.94□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLPP4Q5VZY2 271 aa14.94□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 METTL13Q8N6R0 699 aa14.94□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRSS33Q8NF86 280 aa14.94□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa14.94□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM117Q9H0C3 514 aa14.94□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CEP131Q9UPN4 1083 aa14.94□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LZTS1Q9Y250 596 aa14.94□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ESYT2A0FGR8 921 aa14.93□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLCN3P51790 818 aa14.93□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM189BP81408 668 aa14.93□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLCB3Q01970 1234 aa14.93□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APOBRQ0VD83 1088 aa14.93□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PKN1Q16512 942 aa14.93□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADCK5Q3MIX3 580 aa14.93□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TSGA10IPQ3SY00 556 aa14.93□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RASEFQ8IZ41 740 aa14.93□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa14.93□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HOXA2O43364 376 aa14.92□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSAPP07602 524 aa14.92□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTPN5P54829 565 aa14.92□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SIGLEC14Q08ET2 396 aa14.92□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNC3Q14003 757 aa14.92□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BMP2KLQ5H9B9 411 aa14.92□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MCTP2Q6DN12 878 aa14.92□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa14.92□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC43Q8N309 656 aa14.92□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC01465Q8N7H1 131 aa14.92□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RASGRP4Q8TDF6 673 aa14.92□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM167AQ96KS9 214 aa14.92□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAP7D2Q96T17 732 aa14.92□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TCF25Q9BQ70 676 aa14.92□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZMYND12Q9H0C1 365 aa14.92□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa14.92□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RNF19AQ9NV58 838 aa14.92□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GABBR1Q9UBS5 961 aa14.92□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa14.92□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 USP34Q70CQ2 3546 aa14.92□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADAMTS3O15072 1205 aa14.91□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAGEB2O15479 319 aa14.91□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADD1P35611 737 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPM1AP35813 382 aa14.91□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TECP42680 631 aa14.91□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRT32Q14532 448 aa14.91□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IER5LQ5T953 404 aa14.91□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANKRD54Q6NXT1 300 aa14.91□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LRRC55Q6ZSA7 311 aa14.91□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FBXL6Q8N531 539 aa14.91□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CASD1Q96PB1 797 aa14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms