RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP20.39■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 PLAAQ9Y263 795 aa20.39■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 C10orf76Q5T2E6 689 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 SLFN13Q68D06 897 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 ERMNQ8TAM6 284 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 ACER1Q8TDN7 264 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 MBOAT7Q96N66 472 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 BTNL10A8MVZ5 291 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 CALUO43852 315 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 NR1D1P20393 614 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 KCNA1Q09470 495 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 DGKZQ13574 1117 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 CEP85LQ5SZL2 805 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 KDM7AQ6ZMT4 941 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 LRRC57Q8N9N7 239 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 CENPHQ9H3R5 247 aa20.38■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 RPA1P27694 616 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 PPARDQ03181 441 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 EPHA7Q15375 998 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 BHMT2Q9H2M3 363 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 TMOD2Q9NZR1 351 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM86B1E9PN63 330 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 PDXKO00764 312 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 FLOT1O75955 427 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 GCNT3O95395 438 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 NR3C1P04150 777 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM86B2P0C5J1 330 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 METTL13Q8N6R0 699 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 PBKQ96KB5 322 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa20.37■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 SFI1A8K8P3 1242 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 CD302Q8IX05 232 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 TPCN2Q8NHX9 752 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 SCFD2Q8WU76 684 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 JDP2Q8WYK2 163 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 ISCUQ9H1K1 167 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 IKZF4Q9H2S9 585 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 GCNT4Q9P109 453 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM170AA1A519 330 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 A6NNZ2 444 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 WNT10BO00744 389 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 LSP1P33241 339 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 AP3B2Q13367 1082 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 TUBB8Q3ZCM7 444 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 RUSC1Q9BVN2 902 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 ASTN1O14525 1302 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 CNTNAP1P78357 1384 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 CES2O00748 559 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC26A4O43511 780 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 PEX26Q7Z412 305 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 CRYGNQ8WXF5 182 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 LENG9Q96B70 501 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC17Q96LX7 622 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 EFCC1Q9HA90 598 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 SIX2Q9NPC8 291 aa20.36■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 SART1O43290 800 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 ERLIN2O94905 339 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 ECHS1P30084 290 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 OR2W6PQ8NHA6 318 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 CYP2W1Q8TAV3 490 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 ACTRT1Q8TDG2 376 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC35C1Q96A29 364 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 SPDYE3A6NKU9 549 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 F5H6K3 240 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 HPDP32754 393 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 PRKCIP41743 596 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 KLRC3Q07444 240 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 MOXD1Q6UVY6 613 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 RGL1Q9NZL6 768 aa20.35■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 KRIT1O00522 736 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 TBCAO75347 108 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 GFPT2O94808 682 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 H2AFZP0C0S5 128 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 HSD17B3P37058 310 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 CIAPIN1Q6FI81 312 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC30A10Q6XR72 485 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 H2AFVQ71UI9 128 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 DCAF4Q8WV16 495 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 NEUROG2Q9H2A3 272 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 NDUFB10O96000 172 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 CPP00450 1065 aa20.34■□□□□ 0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 ITGA4P13612 1032 aa20.34■□□□□ 0.85
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