RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 K7ENM7 598 aa23.73■■□□□ 1.39
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SH3BP5-204ENST00000412806 SYT10Q6XYQ8 523 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP5-204ENST00000412806 ATP6V0A1Q93050 837 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP5-204ENST00000412806 GPRC5CQ9NQ84 441 aa23.73■■□□□ 1.39
SH3BP5-204ENST00000412806 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa23.72■■□□□ 1.39
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SH3BP5-204ENST00000412806 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP23.72■■□□□ 1.39
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SH3BP5-204ENST00000412806 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
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SH3BP5-204ENST00000412806 ATG7O95352 703 aa23.69■■□□□ 1.38
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SH3BP5-204ENST00000412806 SLC16A4O15374 487 aa23.67■■□□□ 1.38
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SH3BP5-204ENST00000412806 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
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SH3BP5-204ENST00000412806 LRRC53A6NM62 1247 aa23.67■■□□□ 1.38
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SH3BP5-204ENST00000412806 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
SH3BP5-204ENST00000412806 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP23.67■■□□□ 1.387e-13■■■□□ 17.6
SH3BP5-204ENST00000412806 GTF2BQ00403 316 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP5-204ENST00000412806 APBA1Q02410 837 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP5-204ENST00000412806 GOLGA5Q8TBA6 731 aa23.67■■□□□ 1.38
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