RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411710.1

LIMS1-AS1-201, LIMS1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMS1-AS1, Length 477 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 C16orf92Q96LL3 132 aa4.61□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DSCC1Q9BVC3 393 aa4.61□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 APOL5Q9BWW9 433 aa4.61□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CYP4F12Q9HCS2 524 aa4.61□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DNAJC28Q9NX36 388 aa4.61□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GPRC5BQ9NZH0 403 aa4.61□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 AP4E1Q9UPM8 1137 aa4.61□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa4.61□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa4.61□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 A0A087WV62 115 aa4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LRRC10BA6NIK2 292 aa4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EYA2O00167 538 aa4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KDM1AO60341 852 aa4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SNX2O60749 519 aa4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PAPLNO95428 1278 aa4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SRFP11831 508 aa4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 VAV1P15498 845 aa4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PEX2P28328 305 aa4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 BMP8BP34820 402 aa4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ASPAP45381 313 aa4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CD97P48960 835 aa4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IRF9Q00978 393 aa4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TNFAIP2Q03169 654 aa4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PPFIA1Q13136 1202 aa4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 GPR19Q15760 415 aa4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CRY1Q16526 586 aa4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DUOXA2Q1HG44 320 aa4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ANO6Q4KMQ2 910 aa4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TOR2AQ5JU69 321 aa4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EEF1DP3Q658K8 133 aa4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ICE2Q659A1 982 aa4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DYMQ7RTS9 669 aa4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DTWD1Q8N5C7 304 aa4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PDILTQ8N807 584 aa4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CCDC89Q8N998 374 aa4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DAGLBQ8NCG7 672 aa4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PANK1Q8TE04 598 aa4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DPF3Q92784 378 aa4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ERP27Q96DN0 273 aa4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SLC2A13Q96QE2 648 aa4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RNF208Q9H0X6 261 aa4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NUP62CLQ9H1M0 184 aa4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SEMA4AQ9H3S1 761 aa4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 POLG2Q9UHN1 485 aa4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 SHROOM2Q13796 1616 aa4.6□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MAN2B1O00754 1011 aa4.59□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NCAM2O15394 837 aa4.59□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NCK2O43639 380 aa4.59□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF205O95201 554 aa4.59□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TNFSF4P23510 183 aa4.59□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MANFP55145 182 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ST5P78524 1137 aa4.59□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NBPF8Q3BBV2 869 aa4.59□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ERICH3Q5RHP9 1530 aa4.59□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 IZUMO3Q5VZ72 239 aa4.59□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NUTM2GQ5VZR2 741 aa4.59□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PDXDC1Q6P996 788 aa4.59□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TTLL7Q6ZT98 887 aa4.59□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 NLRP10Q86W26 655 aa4.59□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 FBXO11Q86XK2 927 aa4.59□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LYSMD2Q8IV50 215 aa4.59□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MYCT1Q8N699 235 aa4.59□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TBC1D20Q96BZ9 403 aa4.59□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PTPN18Q99952 460 aa4.59□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 BTBD1Q9H0C5 482 aa4.59□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PRDM12Q9H4Q4 367 aa4.59□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 PIDD1Q9HB75 910 aa4.59□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa4.59□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 TOMM22Q9NS69 142 aa4.59□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CATSPERZQ9NTU4 200 aa4.59□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 ADGRE2Q9UHX3 823 aa4.59□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 CDC23Q9UJX2 597 aa4.59□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa4.59□□□□□ -1.67
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 MAPKBP1O60336 1514 aa4.58□□□□□ -1.68
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa4.58□□□□□ -1.68
LIMS1-AS1-201ENST00000411710 DYTNA2CJ06 578 aa4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.6 ms