RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410062.8

UBE2E3-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-202ENST00000410062 ARID2Q68CP9 1835 aa26.64■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa26.63■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 GHRP10912 638 aa26.63■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 ANKEF1Q9NU02 776 aa26.63■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 GRIN1Q05586 938 aa26.63■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 KRT79Q5XKE5 535 aa26.63■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 MAP7D2Q96T17 732 aa26.63■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 CDHR5Q9HBB8 845 aa26.63■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa26.62■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 ZBBXA8MT70 800 aa26.62■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 ACTN1P12814 892 aa26.62■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 RARRES1P49788 294 aa26.62■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 LPIN1Q14693 890 aa26.62■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 KIZQ2M2Z5 673 aa26.62■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa26.62■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 FBXO47Q5MNV8 452 aa26.62■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 RASIP1Q5U651 963 aa26.62■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 CNKSR3Q6P9H4 555 aa26.62■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 DBF4BQ8NFT6 615 aa26.62■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC7A3Q8WY07 619 aa26.62■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 NACC1Q96RE7 527 aa26.62■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 PPME1Q9Y570 386 aa26.62■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 STK24Q9Y6E0 443 aa26.62■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 KIAA1024Q9UPX6 916 aa26.61■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 GPR32O75388 356 aa26.6■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP26.6■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 RFC5P40937 340 aa26.6■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa26.59■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 MUTP22033 750 aa26.59■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 DNM2P50570 870 aa26.59■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 EMC2Q15006 297 aa26.59■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 LRIT3Q3SXY7 679 aa26.59■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 ZDHHC9Q9Y397 364 aa26.59■■□□□ 1.85
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UBE2E3-202ENST00000410062 TMEM40Q8WWA1 233 aa26.58■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 SEPT8Q92599 483 aa26.58■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 TMEM143Q96AN5 459 aa26.58■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
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UBE2E3-202ENST00000410062 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
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UBE2E3-202ENST00000410062 BRD1O95696 1058 aa26.58■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 NASPP49321 788 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 GPC3P51654 580 aa26.58■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 IKBKEQ14164 716 aa26.58■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC39A14Q15043 492 aa26.58■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa26.58■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 AK8Q96MA6 479 aa26.58■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 MTRQ99707 1265 aa26.58■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 ADAMTS10Q9H324 1103 aa26.58■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa26.58■■□□□ 1.85
UBE2E3-202ENST00000410062 BAIAP3O94812 1187 aa26.57■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 CD52P31358 61 aa26.57■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 RHPN2Q8IUC4 686 aa26.57■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 PLIN2Q99541 437 aa26.57■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa26.57■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 USO1O60763 962 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 DGAT1O75907 488 aa26.56■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 LONP1P36776 959 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 STK38Q15208 465 aa26.56■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 CABP7Q86V35 215 aa26.56■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 KSR1Q8IVT5 923 aa26.56■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 SCLT1Q96NL6 688 aa26.56■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 CLIC6Q96NY7 704 aa26.56■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 CSRNP2Q9H175 543 aa26.56■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa26.56■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 SQORQ9Y6N5 450 aa26.56■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 SZT2Q5T011 3432 aa26.56■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa26.55■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 E9PMD0 336 aa26.55■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 WDR5P61964 334 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 SPECC1Q5M775 1068 aa26.55■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 USP38Q8NB14 1042 aa26.55■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 LINC00301Q8NCQ3 95 aa26.55■■□□□ 1.84
UBE2E3-202ENST00000410062 NLRP7Q8WX94 980 aa26.55■■□□□ 1.84
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