RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP26.01■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa26.01■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 NENFQ9UMX5 172 aa26.01■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 SNAP25P60880 206 aa26■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 ALS2CLQ60I27 953 aa26■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 C8orf74Q6P047 294 aa26■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 LEKR1Q6ZMV7 388 aa26■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 FAM151AQ8WW52 585 aa26■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP26■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 TMEM39BQ9GZU3 492 aa26■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 ODF2LQ9ULJ1 636 aa26■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 EML1O00423 815 aa26■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 GCNT3O95395 438 aa26■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 ZNF131P52739 623 aa26■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 JAM2P57087 298 aa26■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 FAM160B2Q86V87 743 aa26■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 VPS36Q86VN1 386 aa26■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 IFT20Q8IY31 132 aa26■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP26■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa25.99■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 FLOT1O75955 427 aa25.99■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 SLITRK3O94933 977 aa25.99■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 SLC9A1P19634 815 aa25.99■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 SETQ01105 290 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 PTK2Q05397 1052 aa25.99■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 LRCH2Q5VUJ6 765 aa25.99■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 FKBP1CQ5VVH2 108 aa25.99■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 AFAP1L1Q8TED9 768 aa25.99■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 FRMPD4Q14CM0 1322 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 TGFB1I1O43294 461 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 NCK2O43639 380 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 TBC1D12O60347 775 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 FAM13AO94988 1023 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 MYBPC2Q14324 1141 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 NEK9Q8TD19 979 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 PBKQ96KB5 322 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 TEPSINQ96N21 525 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 NACC1Q96RE7 527 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 UIMC1Q96RL1 719 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 FAM204AQ9H8W3 233 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 SIX2Q9NPC8 291 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 GDF3Q9NR23 364 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 GOLGA6BA6NDN3 693 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 AGPSO00116 658 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 ZMYND10O75800 440 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 FERP16591 822 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 CAPN2P17655 700 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 CXCR5P32302 372 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 NPEPPSP55786 919 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 RASA3Q14644 834 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 CYP2W1Q8TAV3 490 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 WDR18Q9BV38 432 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 PARVGQ9HBI0 331 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 NAGPAQ9UK23 515 aa25.98■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 CYP4A11Q02928 519 aa25.97■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 TMEM174Q8WUU8 243 aa25.97■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 LMBR1Q8WVP7 490 aa25.97■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 SH3GL2Q99962 352 aa25.97■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 RSPH10B2B2RC85 870 aa25.96■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 OPA1O60313 960 aa25.96■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 RSPH10BP0C881 870 aa25.96■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 GGCXP38435 758 aa25.96■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 CEP55Q53EZ4 464 aa25.96■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 B3GNT9Q6UX72 402 aa25.96■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 FAM83AQ86UY5 434 aa25.96■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 HDAC7Q8WUI4 952 aa25.96■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 RGL1Q9NZL6 768 aa25.96■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 GOLGA8KD6RF30 607 aa25.96■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 ACTN1P12814 892 aa25.96■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 APBA1Q02410 837 aa25.96■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 PPP2R5AQ15172 486 aa25.96■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 TAF4BQ92750 862 aa25.96■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 DMAC2Q9NW81 257 aa25.96■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 TMEM59LQ9UK28 342 aa25.96■■□□□ 1.75
PMS1-205ENST00000409985 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 GUCY2CP25092 1073 aa25.95■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP25.95■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 SLC9A9Q8IVB4 645 aa25.95■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 DYDC2Q96IM9 177 aa25.95■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 RIT2Q99578 217 aa25.95■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 VCPKMTQ9H867 229 aa25.95■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa25.95■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa25.95■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 ADM5C9JUS6 153 aa25.94■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 TNNC1P63316 161 aa25.94■■□□□ 1.74
PMS1-205ENST00000409985 ARID5AQ03989 594 aa25.94■■□□□ 1.74
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