RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 PDE5AO76074 875 aa10.48□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 ADAMTS2O95450 1211 aa10.48□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 PMS1P54277 932 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 CTSWP56202 376 aa10.48□□□□□ -0.73
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HERC3-202ENST00000402738 TMEM120BA0PK00 339 aa10.47□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
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HERC3-202ENST00000402738 TRPC1P48995 793 aa10.47□□□□□ -0.73
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HERC3-202ENST00000402738 TRABDQ9H4I3 376 aa10.47□□□□□ -0.73
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HERC3-202ENST00000402738 XKR9Q5GH70 373 aa10.47□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa10.47□□□□□ -0.73
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HERC3-202ENST00000402738 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP10.47□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 C1orf54Q8WWF1 131 aa10.47□□□□□ -0.73
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HERC3-202ENST00000402738 ITIH6Q6UXX5 1313 aa10.47□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 SYCE1LA8MT33 242 aa10.47□□□□□ -0.73
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HERC3-202ENST00000402738 SLC12A1Q13621 1099 aa10.47□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
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HERC3-202ENST00000402738 GAP43P17677 238 aa10.46□□□□□ -0.73
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HERC3-202ENST00000402738 KLHL38Q2WGJ6 581 aa10.46□□□□□ -0.73
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HERC3-202ENST00000402738 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
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HERC3-202ENST00000402738 THTPAQ9BU02 230 aa10.46□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 GOLGA8RI6L899 631 aa10.46□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 UFL1O94874 794 aa10.46□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 PYGBP11216 843 aa10.46□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 MXI1P50539 228 aa10.46□□□□□ -0.73
HERC3-202ENST00000402738 ZCWPW2Q504Y3 356 aa10.46□□□□□ -0.73
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HERC3-202ENST00000402738 KCNB1Q14721 858 aa10.46□□□□□ -0.74
HERC3-202ENST00000402738 CEP55Q53EZ4 464 aa10.46□□□□□ -0.74
HERC3-202ENST00000402738 CYB5R4Q7L1T6 521 aa10.46□□□□□ -0.74
HERC3-202ENST00000402738 KCTD6Q8NC69 237 aa10.46□□□□□ -0.74
HERC3-202ENST00000402738 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa10.46□□□□□ -0.74
HERC3-202ENST00000402738 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
HERC3-202ENST00000402738 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
HERC3-202ENST00000402738 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa10.46□□□□□ -0.74
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