RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399451.6

ANKRD28-201, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-201ENST00000399451 PDIK1LQ8N165 341 aa22.96■■□□□ 1.27
ANKRD28-201ENST00000399451 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
ANKRD28-201ENST00000399451 F8W8V4 182 aa22.95■■□□□ 1.27
ANKRD28-201ENST00000399451 TJP3O95049 919 aa22.95■■□□□ 1.27
ANKRD28-201ENST00000399451 CA4P22748 312 aa22.95■■□□□ 1.27
ANKRD28-201ENST00000399451 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.27
ANKRD28-201ENST00000399451 TRIM49BA6NDI0 452 aa22.95■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 GSTA4O15217 222 aa22.95■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 ZNF18P17022 549 aa22.95■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 ART3Q13508 389 aa22.95■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.95■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 ZWILCHQ9H900 591 aa22.95■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 ANO9A1A5B4 782 aa22.95■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 NVLO15381 856 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 SKIP12755 728 aa22.95■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 NFKBIAP25963 317 aa22.95■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 ERICH1Q86X53 443 aa22.95■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 NDUFAF2Q8N183 169 aa22.95■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 NUDCD1Q96RS6 583 aa22.95■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 HSPH1Q92598 858 aa22.95■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 RAD54LQ92698 747 aa22.95■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 SRGAP2O75044 1071 aa22.94■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 SERPINI1Q99574 410 aa22.94■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 ESRRGP62508 458 aa22.94■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.94■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 PSMA2P25787 234 aa22.94■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 INPP1P49441 399 aa22.94■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 FBXO40Q9UH90 709 aa22.94■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 GJB4Q9NTQ9 266 aa22.94■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 MFSD14CQ5VZR4 134 aa22.94■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 LRRC53A6NM62 1247 aa22.93■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 DCTN3O75935 186 aa22.93■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 NUGGCQ68CJ6 796 aa22.93■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 PIDD1Q9HB75 910 aa22.93■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 MMEP08473 750 aa22.93■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 SFI1A8K8P3 1242 aa22.93■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 USP17L5A8MUK1 530 aa22.93■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 CXorf38Q8TB03 319 aa22.93■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 MXD3Q9BW11 206 aa22.93■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 JAK3P52333 1124 aa22.93■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 PEX3P56589 373 aa22.93■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa22.93■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 SAYSD1Q9NPB0 183 aa22.93■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 FEM1BQ9UK73 627 aa22.93■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 MMP19Q99542 508 aa22.92■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 LDHAP00338 332 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 PRCPP42785 496 aa22.92■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 FAF2Q96CS3 445 aa22.92■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 PCDHA6Q9UN73 950 aa22.92■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa22.92■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 MTMR1Q13613 665 aa22.92■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.92■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.92■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 SPARCL1Q14515 664 aa22.92■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 RNF217Q8TC41 542 aa22.92■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.92■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa22.92■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 THNSL1Q8IYQ7 743 aa22.92■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 TRAIPQ9BWF2 469 aa22.92■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 APOEP02649 317 aa22.92■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 MTRQ99707 1265 aa22.92■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 LCMT1Q9UIC8 334 aa22.92■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 TRPA1O75762 1119 aa22.91■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 PRR29P0C7W0 189 aa22.91■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 TERF2Q15554 542 aa22.91■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 PITPNM3Q9BZ71 974 aa22.91■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 RCAN1P53805 252 aa22.91■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 CDO1Q16878 200 aa22.91■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 TTC25Q96NG3 672 aa22.91■■□□□ 1.26
ANKRD28-201ENST00000399451 RMDN3Q96TC7 470 aa22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms