RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399027.3

CYCSP55-201, Transcript of cytochrome c, somatic pseudogene 55, humanhuman

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Gene CYCSP55, Length 311 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYCSP55-201ENST00000399027 CSF2RAP15509 400 aa11.66□□□□□ -0.54
CYCSP55-201ENST00000399027 RFC5P40937 340 aa11.66□□□□□ -0.54
CYCSP55-201ENST00000399027 CCL23P55773 120 aa11.66□□□□□ -0.54
CYCSP55-201ENST00000399027 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
CYCSP55-201ENST00000399027 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP11.66□□□□□ -0.54
CYCSP55-201ENST00000399027 GPNMBQ14956 572 aa11.66□□□□□ -0.54
CYCSP55-201ENST00000399027 XKR9Q5GH70 373 aa11.66□□□□□ -0.54
CYCSP55-201ENST00000399027 CABP7Q86V35 215 aa11.66□□□□□ -0.54
CYCSP55-201ENST00000399027 ZNF710Q8N1W2 664 aa11.66□□□□□ -0.54
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CYCSP55-201ENST00000399027 KCNG4Q8TDN1 519 aa11.66□□□□□ -0.54
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CYCSP55-201ENST00000399027 SCLYQ96I15 445 aa11.66□□□□□ -0.54
CYCSP55-201ENST00000399027 PNMA5Q96PV4 448 aa11.66□□□□□ -0.54
CYCSP55-201ENST00000399027 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
CYCSP55-201ENST00000399027 SH2D3AQ9BRG2 576 aa11.66□□□□□ -0.54
CYCSP55-201ENST00000399027 CCSER1Q9C0I3 900 aa11.66□□□□□ -0.54
CYCSP55-201ENST00000399027 NT5C3AQ9H0P0 336 aa11.66□□□□□ -0.54
CYCSP55-201ENST00000399027 CSRNP2Q9H175 543 aa11.66□□□□□ -0.54
CYCSP55-201ENST00000399027 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
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CYCSP55-201ENST00000399027 KIAA1024Q9UPX6 916 aa11.66□□□□□ -0.54
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CYCSP55-201ENST00000399027 NBNO60934 754 aa11.65□□□□□ -0.54
CYCSP55-201ENST00000399027 DGAT1O75907 488 aa11.65□□□□□ -0.54
CYCSP55-201ENST00000399027 CHRNA1P02708 482 aa11.65□□□□□ -0.54
CYCSP55-201ENST00000399027 RSPH10BP0C881 870 aa11.65□□□□□ -0.54
CYCSP55-201ENST00000399027 TMOD1P28289 359 aa11.65□□□□□ -0.54
CYCSP55-201ENST00000399027 KRT85P78386 507 aa11.65□□□□□ -0.54
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CYCSP55-201ENST00000399027 GRB10Q13322 594 aa11.65□□□□□ -0.54
CYCSP55-201ENST00000399027 MBTPS1Q14703 1052 aa11.65□□□□□ -0.54
CYCSP55-201ENST00000399027 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CYCSP55-201ENST00000399027 TMEM119Q4V9L6 283 aa11.65□□□□□ -0.54
CYCSP55-201ENST00000399027 IER5Q5VY09 327 aa11.65□□□□□ -0.54
CYCSP55-201ENST00000399027 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CYCSP55-201ENST00000399027 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
CYCSP55-201ENST00000399027 SLC7A3Q8WY07 619 aa11.65□□□□□ -0.54
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CYCSP55-201ENST00000399027 IL23AQ9NPF7 189 aa11.65□□□□□ -0.54
CYCSP55-201ENST00000399027 SQORQ9Y6N5 450 aa11.65□□□□□ -0.54
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CYCSP55-201ENST00000399027 EYA4O95677 639 aa11.64□□□□□ -0.55
CYCSP55-201ENST00000399027 UBA7P41226 1012 aa11.64□□□□□ -0.55
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CYCSP55-201ENST00000399027 EMC2Q15006 297 aa11.64□□□□□ -0.55
CYCSP55-201ENST00000399027 C16orf59Q7L2K0 433 aa11.64□□□□□ -0.55
CYCSP55-201ENST00000399027 KCNK18Q7Z418 384 aa11.64□□□□□ -0.55
CYCSP55-201ENST00000399027 LRRC71Q8N4P6 559 aa11.64□□□□□ -0.55
CYCSP55-201ENST00000399027 METTL13Q8N6R0 699 aa11.64□□□□□ -0.55
CYCSP55-201ENST00000399027 TCP11Q8WWU5 503 aa11.64□□□□□ -0.55
CYCSP55-201ENST00000399027 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CYCSP55-201ENST00000399027 CALML4Q96GE6 196 aa11.64□□□□□ -0.55
CYCSP55-201ENST00000399027 EPSTI1Q96J88 318 aa11.64□□□□□ -0.55
CYCSP55-201ENST00000399027 MAP7D2Q96T17 732 aa11.64□□□□□ -0.55
CYCSP55-201ENST00000399027 MTRQ99707 1265 aa11.64□□□□□ -0.55
CYCSP55-201ENST00000399027 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
CYCSP55-201ENST00000399027 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CYCSP55-201ENST00000399027 SUGCTQ9HAC7 445 aa11.64□□□□□ -0.55
CYCSP55-201ENST00000399027 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa11.64□□□□□ -0.55
CYCSP55-201ENST00000399027 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa11.64□□□□□ -0.55
CYCSP55-201ENST00000399027 DNM3Q9UQ16 869 aa11.64□□□□□ -0.55
CYCSP55-201ENST00000399027 TRPV2Q9Y5S1 764 aa11.64□□□□□ -0.55
CYCSP55-201ENST00000399027 CDY2AQ9Y6F7 541 aa11.64□□□□□ -0.55
CYCSP55-201ENST00000399027 A0A087WWV3 80 aa11.63□□□□□ -0.55
CYCSP55-201ENST00000399027 M0QZ92 97 aa11.63□□□□□ -0.55
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CYCSP55-201ENST00000399027 CTSHP09668 335 aa11.63□□□□□ -0.55
CYCSP55-201ENST00000399027 DNM2P50570 870 aa11.63□□□□□ -0.55
CYCSP55-201ENST00000399027 GPC3P51654 580 aa11.63□□□□□ -0.55
CYCSP55-201ENST00000399027 CDC42EP1Q00587 391 aa11.63□□□□□ -0.55
CYCSP55-201ENST00000399027 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa11.63□□□□□ -0.55
CYCSP55-201ENST00000399027 SPECC1Q5M775 1068 aa11.63□□□□□ -0.55
CYCSP55-201ENST00000399027 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
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CYCSP55-201ENST00000399027 LRRC15Q8TF66 581 aa11.63□□□□□ -0.55
CYCSP55-201ENST00000399027 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CYCSP55-201ENST00000399027 OSBPL7Q9BZF2 842 aa11.63□□□□□ -0.55
CYCSP55-201ENST00000399027 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
CYCSP55-201ENST00000399027 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
CYCSP55-201ENST00000399027 BHMT2Q9H2M3 363 aa11.63□□□□□ -0.55
CYCSP55-201ENST00000399027 ADAMTS10Q9H324 1103 aa11.63□□□□□ -0.55
CYCSP55-201ENST00000399027 PCDHA7Q9UN72 937 aa11.63□□□□□ -0.55
CYCSP55-201ENST00000399027 AKT3Q9Y243 479 aa11.63□□□□□ -0.55
CYCSP55-201ENST00000399027 A0A1W2PPC1 479 aa11.62□□□□□ -0.55
CYCSP55-201ENST00000399027 ARHGEF35A5YM69 484 aa11.62□□□□□ -0.55
CYCSP55-201ENST00000399027 USO1O60763 962 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
CYCSP55-201ENST00000399027 CYP11B2P19099 503 aa11.62□□□□□ -0.55
CYCSP55-201ENST00000399027 PLCG1P19174 1290 aa11.62□□□□□ -0.55
CYCSP55-201ENST00000399027 TXLNAP40222 546 aa11.62□□□□□ -0.55
CYCSP55-201ENST00000399027 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
CYCSP55-201ENST00000399027 SLC12A3P55017 1021 aa11.62□□□□□ -0.55
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