RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 RSPH3Q86UC2 560 aa18.53■□□□□ 0.56
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SH3BP4-202ENST00000392011 ZWILCHQ9H900 591 aa18.53■□□□□ 0.56
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SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
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SH3BP4-202ENST00000392011 SWSAP1Q6NVH7 229 aa18.52■□□□□ 0.55
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SH3BP4-202ENST00000392011 WDR24Q96S15 920 aa18.52■□□□□ 0.55
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SH3BP4-202ENST00000392011 HOXC10Q9NYD6 342 aa18.52■□□□□ 0.55
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SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
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SH3BP4-202ENST00000392011 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-202ENST00000392011 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP18.51■□□□□ 0.55
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SH3BP4-202ENST00000392011 MT-ND3P03897 115 aa18.51■□□□□ 0.55
SH3BP4-202ENST00000392011 USP11P51784 963 aa18.51■□□□□ 0.55
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SH3BP4-202ENST00000392011 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa18.51■□□□□ 0.55
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SH3BP4-202ENST00000392011 SH2D3AQ9BRG2 576 aa18.51■□□□□ 0.55
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SH3BP4-202ENST00000392011 CATSPER4Q7RTX7 472 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-202ENST00000392011 GDAP1Q8TB36 358 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-202ENST00000392011 ADAM21Q9UKJ8 722 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-202ENST00000392011 CEP152O94986 1710 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-202ENST00000392011 PSMA2P25787 234 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-202ENST00000392011 CHRNA5P30532 468 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-202ENST00000392011 PRR5LQ6MZQ0 368 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-202ENST00000392011 PDIK1LQ8N165 341 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-202ENST00000392011 OR6B3Q8NGW1 331 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-202ENST00000392011 OSBPL9Q96SU4 736 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-202ENST00000392011 CHP1Q99653 195 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-202ENST00000392011 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-202ENST00000392011 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-202ENST00000392011 GPC4O75487 556 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-202ENST00000392011 KCNB1Q14721 858 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-202ENST00000392011 GLYCTKQ8IVS8 523 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-202ENST00000392011 PLAAQ9Y263 795 aa18.5■□□□□ 0.55
SH3BP4-202ENST00000392011 FLT1P17948 1338 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-202ENST00000392011 PRPSAP1Q14558 356 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-202ENST00000392011 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-202ENST00000392011 SLC27A3Q5K4L6 730 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-202ENST00000392011 SCYL3Q8IZE3 742 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-202ENST00000392011 NBPF3Q9H094 633 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-202ENST00000392011 SCINQ9Y6U3 715 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-202ENST00000392011 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-202ENST00000392011 CA4P22748 312 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF543Q08ER8 600 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-202ENST00000392011 LDHDQ86WU2 507 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-202ENST00000392011 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-202ENST00000392011 TMEM35BQ8NCS4 154 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-202ENST00000392011 KCNF1Q9H3M0 494 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A1W2PQC6 194 aa18.49■□□□□ 0.55
SH3BP4-202ENST00000392011 PDCLQ13371 301 aa18.49■□□□□ 0.55
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