RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348962.6

PTPRO-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,061 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-202ENST00000348962 CDO1Q16878 200 aa16.6■□□□□ 0.25
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PTPRO-202ENST00000348962 HHIPL2Q6UWX4 724 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 LMNTD2Q8IXW0 634 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 STRIP2Q9ULQ0 834 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 STAP1Q9ULZ2 295 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 KBTBD13C9JR72 458 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 E9PMD0 336 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 LARGE1O95461 756 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 KRT33BQ14525 404 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
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PTPRO-202ENST00000348962 ZNF34Q8IZ26 560 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 RAD54LQ92698 747 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 LY9Q9HBG7 655 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 LCMT1Q9UIC8 334 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 ALKQ9UM73 1620 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 MSH2P43246 934 aa16.6■□□□□ 0.25
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PTPRO-202ENST00000348962 GGA3Q9NZ52 723 aa16.6■□□□□ 0.25
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PTPRO-202ENST00000348962 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
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PTPRO-202ENST00000348962 STYK1Q6J9G0 422 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 CAMTA2O94983 1202 aa16.59■□□□□ 0.25
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PTPRO-202ENST00000348962 GPATCH11Q8N954 259 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 OR6J1Q8NGC5 347 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 LXNQ9BS40 222 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 DNAJC12Q9UKB3 198 aa16.59■□□□□ 0.25
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PTPRO-202ENST00000348962 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP16.59■□□□□ 0.25
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PTPRO-202ENST00000348962 PCGF5Q86SE9 256 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 FAM151AQ8WW52 585 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 POTEB3A0JP26 581 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 POTECB2RU33 542 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 CLGNO14967 610 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 HUNKP57058 714 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 RWDD2BP57060 319 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 DBN1Q16643 649 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 POTEBQ6S5H4 581 aa16.59■□□□□ 0.25
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PTPRO-202ENST00000348962 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
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PTPRO-202ENST00000348962 MID2Q9UJV3 735 aa16.58■□□□□ 0.25
PTPRO-202ENST00000348962 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
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PTPRO-202ENST00000348962 TRAPPC3O43617 180 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRO-202ENST00000348962 GCLMP48507 274 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRO-202ENST00000348962 LLGL1Q15334 1064 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRO-202ENST00000348962 ZNF560Q96MR9 790 aa16.58■□□□□ 0.24
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PTPRO-202ENST00000348962 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
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PTPRO-202ENST00000348962 ACAP3Q96P50 834 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRO-202ENST00000348962 ASNSD1Q9NWL6 643 aa16.58■□□□□ 0.24
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PTPRO-202ENST00000348962 USH1CQ9Y6N9 552 aa16.58■□□□□ 0.24
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PTPRO-202ENST00000348962 SLC15A2Q16348 729 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRO-202ENST00000348962 TMEM270Q6UE05 265 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRO-202ENST00000348962 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
PTPRO-202ENST00000348962 CPB1P15086 417 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRO-202ENST00000348962 AP3M2P53677 418 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRO-202ENST00000348962 NUDT18Q6ZVK8 323 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRO-202ENST00000348962 SGMS1Q86VZ5 419 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRO-202ENST00000348962 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
PTPRO-202ENST00000348962 NYAP2Q9P242 653 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRO-202ENST00000348962 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
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