RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 PFKFB2O60825 505 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 SMPD1P17405 629 aa4.88□□□□□ -1.63
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PTPRC-201ENST00000348564 CDC25AP30304 524 aa4.88□□□□□ -1.63
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PTPRC-201ENST00000348564 BEST2Q8NFU1 509 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 SMARCE1Q969G3 411 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 GJA10Q969M2 543 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 FTHL17Q9BXU8 183 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
PTPRC-201ENST00000348564 KIF9Q9HAQ2 790 aa4.87□□□□□ -1.63
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