RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321358.11

YBX1-201, Transcript of Y-box binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene YBX1, Length 1,514 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX1-201ENST00000321358 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 NFKBIBQ15653 356 aa23.5■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 TIPINQ9BVW5 301 aa23.5■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 SUGCTQ9HAC7 445 aa23.5■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 MROH7Q68CQ1 1323 aa23.5■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 MYL1P05976 194 aa23.49■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 COL6A1P12109 1028 aa23.49■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 EMC2Q15006 297 aa23.49■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 MTHFD1LQ6UB35 978 aa23.49■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa23.49■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 SLC43A3Q8NBI5 491 aa23.49■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 STAMQ92783 540 aa23.49■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 PAGE5Q96GU1 130 aa23.49■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 MTRQ99707 1265 aa23.49■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 EFCAB12Q6NXP0 572 aa23.49■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 C1orf186Q6ZWK4 172 aa23.49■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 GPT2Q8TD30 523 aa23.49■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 TCP11Q8WWU5 503 aa23.49■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 C22orf31O95567 290 aa23.48■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 GUCY2CP25092 1073 aa23.48■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 HOXC8P31273 242 aa23.48■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 PTGISQ16647 500 aa23.48■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 MARCH8Q5T0T0 291 aa23.48■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 FAM102BQ5T8I3 360 aa23.48■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 TAF2Q6P1X5 1199 aa23.48■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 MAEAQ7L5Y9 396 aa23.48■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 DDX12PQ92771 950 aa23.48■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 CEP89Q96ST8 783 aa23.48■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 RUSC1Q9BVN2 902 aa23.48■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa23.48■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 MYMKA6NI61 221 aa23.47■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 TLR3O15455 904 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 TREHO43280 583 aa23.47■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 TBCAO75347 108 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 CYP2C9P11712 490 aa23.47■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 CDK7P50613 346 aa23.47■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 ADAM17P78536 824 aa23.47■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa23.47■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 DYMQ7RTS9 669 aa23.47■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 DRC1Q96MC2 740 aa23.47■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 MAP7D2Q96T17 732 aa23.47■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 C7orf25Q9BPX7 421 aa23.47■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 DCDC2CA8MYV0 355 aa23.46■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 POSTNQ15063 836 aa23.46■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 ARSHQ5FYA8 562 aa23.46■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 C1orf53Q5VUE5 145 aa23.46■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 IER5Q5VY09 327 aa23.46■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 RSPH3Q86UC2 560 aa23.46■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 KIFAP3Q92845 792 aa23.46■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 TRIM9Q9C026 710 aa23.46■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 ODF2LQ9ULJ1 636 aa23.46■■□□□ 1.35
YBX1-201ENST00000321358 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa23.45■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa23.45■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 IDEP14735 1019 aa23.45■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 ASIC1P78348 528 aa23.45■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa23.45■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 LRRC71Q8N4P6 559 aa23.45■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 TMEM143Q96AN5 459 aa23.45■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 ZHX3Q9H4I2 956 aa23.45■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 PDLIM7Q9NR12 457 aa23.45■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 KCNG1Q9UIX4 513 aa23.45■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 FRMPD3Q5JV73 1810 aa23.45■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 FAM13AO94988 1023 aa23.44■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 SMC2O95347 1197 aa23.44■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa23.44■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 CCDC65Q8IXS2 484 aa23.44■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 NME8Q8N427 588 aa23.44■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 IFT74Q96LB3 600 aa23.44■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 NUP62CLQ9H1M0 184 aa23.44■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 AKT3Q9Y243 479 aa23.44■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa23.44■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa23.44■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa23.43■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 B4GALT4O60513 344 aa23.43■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 HIP1RO75146 1068 aa23.43■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 CLCN3P51790 818 aa23.43■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 CDC42EP1Q00587 391 aa23.43■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 PTK7Q13308 1070 aa23.43■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 GIT2Q14161 759 aa23.43■■□□□ 1.34
YBX1-201ENST00000321358 HIC1Q14526 733 aa23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms