RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317991.9

GRAMD1A-201, Transcript of GRAM domain containing 1A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GRAMD1A, Length 2,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1A-201ENST00000317991 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 PMS2P54278 862 aa24.21■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC29A2Q14542 456 aa24.21■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 EDRF1Q3B7T1 1238 aa24.21■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 DUPD1Q68J44 220 aa24.21■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 GLYCTKQ8IVS8 523 aa24.21■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC63Q8NA47 563 aa24.21■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 FBXO25Q8TCJ0 367 aa24.21■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 SMARCA1P28370 1054 aa24.21■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 MMP13P45452 471 aa24.21■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLCO1A2P46721 670 aa24.21■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 PPP4CP60510 307 aa24.21■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 PSMC6P62333 389 aa24.21■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 PIGWQ7Z7B1 504 aa24.21■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 ERP44Q9BS26 406 aa24.21■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 AGAP1Q9UPQ3 857 aa24.21■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 MEIS1O00470 390 aa24.2■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 RFC4P35249 363 aa24.2■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 BTDP43251 543 aa24.2■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.2■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 SYCE1Q8N0S2 351 aa24.2■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 ANKS4BQ8N8V4 417 aa24.2■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 NLRP3Q96P20 1036 aa24.2■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 NT5C3AQ9H0P0 336 aa24.2■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 IKZF4Q9H2S9 585 aa24.2■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF287Q9HBT7 754 aa24.2■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 GCNT4Q9P109 453 aa24.2■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC12A4Q9UP95 1085 aa24.2■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa24.2■■□□□ 1.47
GRAMD1A-201ENST00000317991 DOT1LQ8TEK3 1739 aa24.2■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 VIMP08670 466 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 NT5C2P49902 561 aa24.2■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 JAM2P57087 298 aa24.2■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 PTENP60484 403 aa24.2■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 KLRC3Q07444 240 aa24.2■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 FRMD5Q7Z6J6 570 aa24.2■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 HOOK3Q86VS8 718 aa24.2■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 ABCF3Q9NUQ8 709 aa24.2■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 CLIC2O15247 247 aa24.19■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 NAA25Q14CX7 972 aa24.19■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 TTBK2Q6IQ55 1244 aa24.19■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 SEMA4AQ9H3S1 761 aa24.19■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 IRS2Q9Y4H2 1338 aa24.19■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC16A2P36021 539 aa24.19■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 KCNA1Q09470 495 aa24.19■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 MYO1EQ12965 1108 aa24.19■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 NBPF9Q3BBW0 867 aa24.19■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 HYIQ5T013 277 aa24.19■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 VPS36Q86VN1 386 aa24.19■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 TEX11Q8IYF3 940 aa24.19■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 OLIG1Q8TAK6 271 aa24.19■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 WDR66Q8TBY9 1149 aa24.19■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 NEK9Q8TD19 979 aa24.19■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 RAB17Q9H0T7 212 aa24.19■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 JMJD4Q9H9V9 463 aa24.19■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC12A3P55017 1021 aa24.18■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 DENND2CQ68D51 928 aa24.18■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZDHHC24Q6UX98 284 aa24.18■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 SFR1Q86XK3 245 aa24.18■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAXDC2Q96IV6 333 aa24.18■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMOD4Q9NZQ9 345 aa24.18■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa24.18■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 EVI5O60447 810 aa24.18■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC38Q502W7 563 aa24.18■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa24.18■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 CD2APQ9Y5K6 639 aa24.18■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 MAST2Q6P0Q8 1798 aa24.18■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa24.18■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 ASAP2O43150 1006 aa24.18■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 NUDT17P0C025 328 aa24.18■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP24.18■■□□□ 1.462e-6■■■■□ 19.3
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC10A5Q5PT55 438 aa24.18■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa24.18■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 ADGRF4Q8IZF3 695 aa24.18■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC35C1Q96A29 364 aa24.18■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARHGEF26Q96DR7 871 aa24.18■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC113Q9H0I3 377 aa24.18■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 NAV1Q8NEY1 1877 aa24.17■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa24.17■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 TAX1BP1Q86VP1 789 aa24.17■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 JAMLQ86YT9 394 aa24.17■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 NSMCE1Q8WV22 266 aa24.17■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 ALG3Q92685 438 aa24.17■■□□□ 1.46
GRAMD1A-201ENST00000317991 C18orf8Q96DM3 657 aa24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.1 ms