RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317945.6

CCDC34-201, Transcript of coiled-coil domain containing 34, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC34, Length 2,109 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34-201ENST00000317945 LENG9Q96B70 501 aa20.52■□□□□ 0.88
CCDC34-201ENST00000317945 AP1M1Q9BXS5 423 aa20.52■□□□□ 0.88
CCDC34-201ENST00000317945 STK33Q9BYT3 514 aa20.52■□□□□ 0.88
CCDC34-201ENST00000317945 RAB17Q9H0T7 212 aa20.52■□□□□ 0.88
CCDC34-201ENST00000317945 CAPN7Q9Y6W3 813 aa20.52■□□□□ 0.88
CCDC34-201ENST00000317945 LY75O60449 1722 aa20.52■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 GMNCA6NCL1 334 aa20.51■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 SERPINB2P05120 415 aa20.51■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 TCERG1LQ5VWI1 586 aa20.51■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 SLFN13Q68D06 897 aa20.51■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 DAAM2Q86T65 1068 aa20.51■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 RFFLQ8WZ73 363 aa20.51■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 UBE4BO95155 1302 aa20.51■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 SOX5P35711 763 aa20.51■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 PPP2R2AP63151 447 aa20.51■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 TMC3Q7Z5M5 1100 aa20.51■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 SPDYE3A6NKU9 549 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 E7EVH7 732 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 MYO1FO00160 1098 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 TRAPPC3O43617 180 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 CYP3A4P08684 503 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 GALCP54803 685 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 LTBP1Q14766 1721 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 CABS1Q96KC9 395 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 CARD9Q9H257 536 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 NEUROG2Q9H2A3 272 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 LRRC37AA6NMS7 1700 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 TRIM37O94972 964 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 GCNT3O95395 438 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 CDR1P51861 262 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 DDR1Q08345 913 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 AMACRQ9UHK6 382 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 VAV3Q9UKW4 847 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa20.5■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 C5orf60A6NFR6 353 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 DAPK3O43293 454 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 EVI5O60447 810 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 SEC24CP53992 1094 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 PPATQ06203 517 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 CYFIP2Q96F07 1278 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 GOLPH3Q9H4A6 298 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 SEL1LQ9UBV2 794 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 USP21Q9UK80 565 aa20.49■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 FAM187AA6NFU0 413 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 H0YHG0 523 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 MEIS1O00470 390 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 TGFB1I1O43294 461 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 PPFIA2O75334 1257 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 EEF2P13639 858 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 MUTP22033 750 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 RFX1P22670 979 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 HPDP32754 393 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 CASP4P49662 377 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 PTENP60484 403 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 SETQ01105 290 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 FAM186BQ8IYM0 893 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 CERS5Q8N5B7 392 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 P3H4Q92791 437 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 TEKT1Q969V4 418 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 SYT11Q9BT88 431 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 BHMT2Q9H2M3 363 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 VCPKMTQ9H867 229 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 TUFT1Q9NNX1 390 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 F8VZ95 297 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 DRG2P55039 364 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 PPP2R5AQ15172 486 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 FBXW10Q5XX13 1052 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 KCNV1Q6PIU1 500 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 TAX1BP1Q86VP1 789 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 FBXO11Q86XK2 927 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 OLIG1Q8TAK6 271 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 VTI1AQ96AJ9 217 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 CENPTQ96BT3 561 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 TXLNGYQ9BZA5 131 aa20.48■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 FAM86B1E9PN63 330 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 MSH4O15457 936 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 TTI1O43156 1089 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 FAM86B2P0C5J1 330 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 ITGA4P13612 1032 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 GYS1P13807 737 aa20.47■□□□□ 0.87
CCDC34-201ENST00000317945 SMTNP53814 917 aa20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms