RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 SFI1A8K8P3 1242 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 AGPSO00116 658 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 GUCY2CP25092 1073 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 NMT1P30419 496 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 KCNA1Q09470 495 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 MYBPC2Q14324 1141 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 SPDYE2Q495Y8 402 aa21.36■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 PSME4Q14997 1843 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 GOLGA8KD6RF30 607 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC172P0C7W6 258 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 PAK2Q13177 524 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 CLRN2A0PK11 232 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 H2AFZP0C0S5 128 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 NOP2P46087 812 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 NPEPPSP55786 919 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 B3GNT9Q6UX72 402 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 H2AFVQ71UI9 128 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 RTKN2Q8IZC4 609 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 SYCE1Q8N0S2 351 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 USP38Q8NB14 1042 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 GMLQ99445 158 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 DMAC2Q9NW81 257 aa21.35■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 KIF4AO95239 1232 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 BCRP11274 1271 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 SLC9A9Q8IVB4 645 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 FIZ1Q96SL8 496 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 STK33Q9BYT3 514 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 UNC45AQ9H3U1 944 aa21.34■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
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SPNS1-201ENST00000311008 FMO5P49326 533 aa21.33■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 CNTNAP1P78357 1384 aa21.33■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 PPFIA1Q13136 1202 aa21.33■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 ODR4Q5SWX8 454 aa21.33■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 LDHDQ86WU2 507 aa21.33■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 LRRC57Q8N9N7 239 aa21.33■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 FAM76AQ8TAV0 307 aa21.33■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 MXRA8Q9BRK3 442 aa21.33■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM59LQ9UK28 342 aa21.33■■□□□ 1.01
SPNS1-201ENST00000311008 ARHGEF35A5YM69 484 aa21.33■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 C21orf2O43822 256 aa21.33■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 LMNB1P20700 586 aa21.33■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 ALCAMQ13740 583 aa21.33■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 TNIP1Q15025 636 aa21.33■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 FAM83AQ86UY5 434 aa21.33■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 ACTRT1Q8TDG2 376 aa21.33■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 RUFY1Q96T51 708 aa21.33■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 PSMD1Q99460 953 aa21.33■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 SH3GL2Q99962 352 aa21.33■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa21.33■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 GOLGA6CA6NDK9 693 aa21.32■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 GOLGA6DP0CG33 693 aa21.32■■□□□ 1
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SPNS1-201ENST00000311008 SOX5P35711 763 aa21.32■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 CAP2P40123 477 aa21.32■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 NIPA1Q7RTP0 329 aa21.32■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 TPCN2Q8NHX9 752 aa21.32■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 BCAS3Q9H6U6 928 aa21.32■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa21.32■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 KCNK3O14649 394 aa21.32■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 ARP10275 920 aa21.32■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 HSD17B4P51659 736 aa21.32■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 SLFN11Q7Z7L1 901 aa21.32■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 MTMR14Q8NCE2 650 aa21.32■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 LXNQ9BS40 222 aa21.32■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 POLD4Q9HCU8 107 aa21.32■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa21.32■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 GLI1P08151 1106 aa21.31■■□□□ 1
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SPNS1-201ENST00000311008 POLD1P28340 1107 aa21.31■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 MREGQ8N565 214 aa21.31■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 VTI1AQ96AJ9 217 aa21.31■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 KRT12Q99456 494 aa21.31■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 VPS33BQ9H267 617 aa21.31■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 EPB41L5Q9HCM4 733 aa21.31■■□□□ 1
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SPNS1-201ENST00000311008 F8VZ95 297 aa21.31■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 ICAM1P05362 532 aa21.31■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 ASNSP08243 561 aa21.31■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 DNA2P51530 1060 aa21.31■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 UBXN2AP68543 259 aa21.31■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 WHAMMQ8TF30 809 aa21.31■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM174Q8WUU8 243 aa21.31■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 ZBTB9Q96C00 473 aa21.31■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 HINFPQ9BQA5 517 aa21.31■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 STRA6Q9BX79 667 aa21.31■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa21.3■■□□□ 1
SPNS1-201ENST00000311008 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP21.3■■□□□ 11e-12■■■□□ 19
SPNS1-201ENST00000311008 ZBTB39O15060 712 aa21.3■■□□□ 1
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