RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 OSGEPQ9NPF4 335 aa16.24■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 FAM114A2Q9NRY5 505 aa16.24■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 NR2E1Q9Y466 385 aa16.24■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 KRT71Q3SY84 523 aa16.24■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 ETNPPLQ8TBG4 499 aa16.24■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 ATP8B4Q8TF62 1192 aa16.24■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 TRIM51Q9BSJ1 452 aa16.24■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP16.24■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 GGA1Q9UJY5 639 aa16.24■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 AMFRQ9UKV5 643 aa16.24■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 RSPH10B2B2RC85 870 aa16.23■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 DNM1LO00429 736 aa16.23■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 GFPT2O94808 682 aa16.23■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 FGGP02679 453 aa16.23■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 RSPH10BP0C881 870 aa16.23■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 SHMT1P34896 483 aa16.23■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 BMT2Q1RMZ1 405 aa16.23■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 QRICH1Q2TAL8 776 aa16.23■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 SLC30A5Q8TAD4 765 aa16.23■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 MXD3Q9BW11 206 aa16.23■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 TXLNGYQ9BZA5 131 aa16.23■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 DNM3Q9UQ16 869 aa16.23■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 C10orf71Q711Q0 1435 aa16.23■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 CLIC2O15247 247 aa16.23■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 TRIM37O94972 964 aa16.23■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 FERP16591 822 aa16.23■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 KCNA1Q09470 495 aa16.23■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 DCAF12L1Q5VU92 463 aa16.23■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 POTEAQ6S8J7 498 aa16.23■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 CNBD1Q8NA66 436 aa16.23■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa16.23■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 TATDN2Q93075 761 aa16.23■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 TRIM31Q9BZY9 425 aa16.23■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 SERPINB13Q9UIV8 391 aa16.23■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 PPFIA2O75334 1257 aa16.22■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 RPA1P27694 616 aa16.22■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 PRR16Q569H4 304 aa16.22■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa16.22■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 TLCD1Q96CP7 247 aa16.22■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 CCDC114Q96M63 670 aa16.22■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 PSMD1Q99460 953 aa16.22■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa16.22■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa16.22■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa16.22■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa16.22■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 CHUKO15111 745 aa16.22■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 EVI5O60447 810 aa16.22■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 RPL13P26373 211 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 STAT1P42224 750 aa16.22■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa16.22■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 GPATCH11Q8N954 259 aa16.22■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 SLC35G2Q8TBE7 412 aa16.22■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 CRYGNQ8WXF5 182 aa16.22■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 FMO2Q99518 471 aa16.22■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 GLT8D2Q9H1C3 349 aa16.22■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa16.22■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 NCANO14594 1321 aa16.21■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 MYO3BQ8WXR4 1341 aa16.21■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 PHF20L1A8MW92 1017 aa16.21■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 MEIS2O14770 477 aa16.21■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 GCNT3O95395 438 aa16.21■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 MAP2K2P36507 400 aa16.21■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 ARHGAP4P98171 946 aa16.21■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 PPATQ06203 517 aa16.21■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 MOXD1Q6UVY6 613 aa16.21■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 ERMNQ8TAM6 284 aa16.21■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 BORCS6Q96GS4 357 aa16.21■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 POLLQ9UGP5 575 aa16.21■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa16.21■□□□□ 0.19
SYP-201ENST00000263233 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa16.21■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 PTENP60484 403 aa16.21■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 ARMC9Q7Z3E5 817 aa16.21■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 GLYCTKQ8IVS8 523 aa16.21■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 MDM1Q8TC05 714 aa16.21■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 LENG9Q96B70 501 aa16.21■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 RUSC1Q9BVN2 902 aa16.21■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 RAB17Q9H0T7 212 aa16.21■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 BRWD3Q6RI45 1802 aa16.2■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 TGFB1I1O43294 461 aa16.2■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 TMEM253P0C7T8 217 aa16.2■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 SLURP2P0DP57 97 aa16.2■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 DRD4P21917 467 aa16.2■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 SOX5P35711 763 aa16.2■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
SYP-201ENST00000263233 IFFO1Q0D2I5 559 aa16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms