RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 THAP2Q9H0W7 228 aa14.56□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 FOXO6A8MYZ6 492 aa14.56□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 MSH4O15457 936 aa14.56□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 ECE1P42892 770 aa14.56□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 PPM1KQ8N3J5 372 aa14.56□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 IQCDQ96DY2 449 aa14.56□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 PJA2O43164 708 aa14.55□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 CRKP46108 304 aa14.55□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 PTGISQ16647 500 aa14.55□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 ABCB5Q2M3G0 1257 aa14.55□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 ZCWPW2Q504Y3 356 aa14.55□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 MICALCLQ6ZW33 695 aa14.55□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 CCDC105Q8IYK2 499 aa14.55□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 ANKRD42Q8N9B4 389 aa14.55□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa14.55□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 TBC1D31Q96DN5 1066 aa14.55□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 GANQ9H2C0 597 aa14.55□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 KCNK9Q9NPC2 374 aa14.55□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 ESYT2A0FGR8 921 aa14.55□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 SPOPO43791 374 aa14.55□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 FGFR4P22455 802 aa14.55□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 USP11P51784 963 aa14.55□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 CAPN12Q6ZSI9 719 aa14.55□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 SLFN12Q8IYM2 578 aa14.55□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 WHAMMQ8TF30 809 aa14.55□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 SLC20A1Q8WUM9 679 aa14.55□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 ARHGEF26Q96DR7 871 aa14.55□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 EPN3Q9H201 632 aa14.55□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 GDF3Q9NR23 364 aa14.55□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 PCNTO95613 3336 aa14.55□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 RPS6KA5O75582 802 aa14.54□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 CPNE8Q86YQ8 564 aa14.54□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 PIK3R5Q8WYR1 880 aa14.54□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 SNED1Q8TER0 1413 aa14.54□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 BBOX1O75936 387 aa14.54□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 NDUFB10O96000 172 aa14.54□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 SLC12A3P55017 1021 aa14.54□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 QPCTQ16769 361 aa14.54□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa14.54□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 PLCB1Q9NQ66 1216 aa14.54□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 TBK1Q9UHD2 729 aa14.54□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa14.54□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa14.54□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa14.54□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 GYS1P13807 737 aa14.54□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 CBWD6Q4V339 395 aa14.54□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 CBWD3Q5JTY5 395 aa14.54□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 CBWD5Q5RIA9 395 aa14.54□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF662Q6ZS27 426 aa14.54□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 FMO2Q99518 471 aa14.54□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 SH3GL2Q99962 352 aa14.54□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa14.53□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 ARHGEF35A5YM69 484 aa14.53□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 K7ENM7 598 aa14.53□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 MEIS2O14770 477 aa14.53□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 SHBGP04278 402 aa14.53□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa14.53□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 MARCKSL1P49006 195 aa14.53□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 DR1Q01658 176 aa14.53□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 KAT5Q92993 513 aa14.53□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 CAVIN3Q969G5 261 aa14.53□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 SLC35C1Q96A29 364 aa14.53□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 C18orf8Q96DM3 657 aa14.53□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa14.53□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa14.53□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 CCDC169A6NNP5 214 aa14.53□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 CAND2O75155 1236 aa14.53□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 ACSL3O95573 720 aa14.53□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 FTLP02792 175 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 HOXD13P35453 343 aa14.53□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF844Q08AG5 666 aa14.53□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 SLC30A5Q8TAD4 765 aa14.53□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 CSRNP1Q96S65 589 aa14.53□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 AIPL1Q9NZN9 384 aa14.53□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 USP20Q9Y2K6 914 aa14.53□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa14.53□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 GMNCA6NCL1 334 aa14.53□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 RPSAP08865 295 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa14.53□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 CYFIP2Q96F07 1278 aa14.53□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 FBXO28Q9NVF7 368 aa14.53□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 RNF14Q9UBS8 474 aa14.53□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa14.53□□□□□ -0.08
TMOD1-201ENST00000259365 TIAM2Q8IVF5 1701 aa14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms