RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257818.2

LMO2-201, Transcript of LIM domain only 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO2, Length 2,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2-201ENST00000257818 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
LMO2-201ENST00000257818 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
LMO2-201ENST00000257818 SLFN13Q68D06 897 aa26.92■■□□□ 1.9
LMO2-201ENST00000257818 SLC16A10Q8TF71 515 aa26.92■■□□□ 1.9
LMO2-201ENST00000257818 CUL5Q93034 780 aa26.92■■□□□ 1.9
LMO2-201ENST00000257818 LRRC45Q96CN5 670 aa26.92■■□□□ 1.9
LMO2-201ENST00000257818 CYFIP2Q96F07 1278 aa26.92■■□□□ 1.9
LMO2-201ENST00000257818 NENFQ9UMX5 172 aa26.92■■□□□ 1.9
LMO2-201ENST00000257818 KIF13BQ9NQT8 1826 aa26.91■■□□□ 1.9
LMO2-201ENST00000257818 ATRNL1Q5VV63 1379 aa26.91■■□□□ 1.9
LMO2-201ENST00000257818 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
LMO2-201ENST00000257818 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
LMO2-201ENST00000257818 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa26.91■■□□□ 1.9
LMO2-201ENST00000257818 TMEM179Q6ZVK1 233 aa26.91■■□□□ 1.9
LMO2-201ENST00000257818 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa26.91■■□□□ 1.9
LMO2-201ENST00000257818 SPAG5Q96R06 1193 aa26.91■■□□□ 1.9
LMO2-201ENST00000257818 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP26.91■■□□□ 1.92e-9■■■□□ 19
LMO2-201ENST00000257818 ZBTB5O15062 677 aa26.91■■□□□ 1.9
LMO2-201ENST00000257818 ITGA4P13612 1032 aa26.91■■□□□ 1.9
LMO2-201ENST00000257818 PON1P27169 355 aa26.91■■□□□ 1.9
LMO2-201ENST00000257818 GMLQ99445 158 aa26.91■■□□□ 1.9
LMO2-201ENST00000257818 NCAPGQ9BPX3 1015 aa26.91■■□□□ 1.9
LMO2-201ENST00000257818 FBXL5Q9UKA1 691 aa26.91■■□□□ 1.9
LMO2-201ENST00000257818 ZBTB7AO95365 584 aa26.9■■□□□ 1.9
LMO2-201ENST00000257818 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
LMO2-201ENST00000257818 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
LMO2-201ENST00000257818 ZHX3Q9H4I2 956 aa26.9■■□□□ 1.9
LMO2-201ENST00000257818 VCPKMTQ9H867 229 aa26.9■■□□□ 1.9
LMO2-201ENST00000257818 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
LMO2-201ENST00000257818 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
LMO2-201ENST00000257818 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
LMO2-201ENST00000257818 MED24O75448 989 aa26.9■■□□□ 1.9
LMO2-201ENST00000257818 GH2P01242 217 aa26.9■■□□□ 1.9
LMO2-201ENST00000257818 SLC12A3P55017 1021 aa26.9■■□□□ 1.9
LMO2-201ENST00000257818 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
LMO2-201ENST00000257818 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa26.9■■□□□ 1.9
LMO2-201ENST00000257818 HOXD13P35453 343 aa26.89■■□□□ 1.9
LMO2-201ENST00000257818 STAT3P40763 770 aa26.89■■□□□ 1.9
LMO2-201ENST00000257818 DLGAP5Q15398 846 aa26.89■■□□□ 1.9
LMO2-201ENST00000257818 TMOD2Q9NZR1 351 aa26.89■■□□□ 1.9
LMO2-201ENST00000257818 AMACRQ9UHK6 382 aa26.89■■□□□ 1.9
LMO2-201ENST00000257818 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
LMO2-201ENST00000257818 KRIT1O00522 736 aa26.88■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 AFPP02771 609 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 TMOD1P28289 359 aa26.88■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 PRKCIP41743 596 aa26.88■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 FRMD5Q7Z6J6 570 aa26.88■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 SLFN11Q7Z7L1 901 aa26.88■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 OGFOD1Q8N543 542 aa26.88■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 GMNCA6NCL1 334 aa26.88■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 DAPK3O43293 454 aa26.88■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 BIRC3Q13489 604 aa26.88■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 EXOC3L4Q17RC7 722 aa26.88■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 CCDC13Q8IYE1 715 aa26.88■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 RASGEF1CQ8N431 466 aa26.88■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 DCAF4Q8WV16 495 aa26.88■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 PSTPIP2Q9H939 334 aa26.88■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa26.88■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 POTEFA5A3E0 1075 aa26.87■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 TMCO5BA8MYB1 307 aa26.87■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 F5H6K3 240 aa26.87■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 TRAPPC3O43617 180 aa26.87■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 KRT18P05783 430 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 POTEIP0CG38 1075 aa26.87■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 KLRC3Q07444 240 aa26.87■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 POTEGQ6S5H5 508 aa26.87■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 POTEEQ6S8J3 1075 aa26.87■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 QPCTQ16769 361 aa26.87■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 PEX26Q7Z412 305 aa26.87■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP26.87■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 KCNMB3Q9NPA1 279 aa26.87■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 SIX2Q9NPC8 291 aa26.87■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa26.86■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 CCDC188H7C350 402 aa26.86■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 EPHA7Q15375 998 aa26.86■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 QRICH1Q2TAL8 776 aa26.86■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 RUFY4Q6ZNE9 571 aa26.86■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa26.86■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP26.86■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 DCDC2CA8MYV0 355 aa26.86■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 FLOT1O75955 427 aa26.86■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 TMC3Q7Z5M5 1100 aa26.86■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 CCDC91Q7Z6B0 441 aa26.86■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 ZNRF3Q9ULT6 936 aa26.86■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 USP17L15C9J2P7 530 aa26.85■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 USP17L13C9JLJ4 530 aa26.85■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 USP17L11C9JVI0 530 aa26.85■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 USP17L18D6R9N7 530 aa26.85■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 USP17L22D6RA61 530 aa26.85■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 USP17L17D6RBQ6 530 aa26.85■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 USP17L19D6RCP7 530 aa26.85■■□□□ 1.89
LMO2-201ENST00000257818 USP17L20D6RJB6 530 aa26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms