RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 TRAF1Q13077 416 aa22.06■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 IQCKQ8N0W5 287 aa22.06■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 OTUD6BQ8N6M0 293 aa22.06■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 MICALCLQ6ZW33 695 aa22.05■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 UNC13DQ70J99 1090 aa22.05■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 WDR18Q9BV38 432 aa22.05■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 ALAS1P13196 640 aa22.05■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 LRRC63Q05C16 580 aa22.05■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 MOXD1Q6UVY6 613 aa22.05■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 CNPY4Q8N129 248 aa22.05■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 MREGQ8N565 214 aa22.05■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa22.05■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 CAPN7Q9Y6W3 813 aa22.05■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa22.04■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 ZNF233A6NK53 670 aa22.04■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 MSH4O15457 936 aa22.04■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.04■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 Q4G0T1 1027 aa22.04■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 NCAPGQ9BPX3 1015 aa22.04■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa22.04■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 FAM153BP0C7A2 387 aa22.04■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 LSP1P33241 339 aa22.04■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 MNAT1P51948 309 aa22.04■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 FAM153CQ494X1 144 aa22.04■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 EPN3Q9H201 632 aa22.04■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 COL20A1Q9P218 1284 aa22.04■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 FAM153AQ9UHL3 310 aa22.04■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 ESYT3A0FGR9 886 aa22.03■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 CIITAP33076 1130 aa22.03■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.03■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 CD302Q8IX05 232 aa22.03■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.03■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 ATG4CQ96DT6 458 aa22.03■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 TSG101Q99816 390 aa22.03■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 AS3MTQ9HBK9 375 aa22.03■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 STK17AQ9UEE5 414 aa22.03■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.03■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 DOCK1Q14185 1865 aa22.03■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 GRID2IPA4D2P6 1211 aa22.03■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 MYMKA6NI61 221 aa22.03■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.03■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 NR1D1P20393 614 aa22.03■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 GUCY2FP51841 1108 aa22.03■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 SPIRE1Q08AE8 756 aa22.03■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 HGSNATQ68CP4 663 aa22.03■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 KCNV1Q6PIU1 500 aa22.03■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 DYMQ7RTS9 669 aa22.03■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 CCDC91Q7Z6B0 441 aa22.03■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa22.02■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 H0YHG0 523 aa22.02■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 CYP3A4P08684 503 aa22.02■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 DNA2P51530 1060 aa22.02■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 SLFN12Q8IYM2 578 aa22.02■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22.02■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 WHAMMQ8TF30 809 aa22.02■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 PALMO75781 387 aa22.02■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 GUCY1A3Q02108 690 aa22.02■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 TMEM119Q4V9L6 283 aa22.02■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 LRRC55Q6ZSA7 311 aa22.02■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.02■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 KRT12Q99456 494 aa22.02■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 KIAA1024Q9UPX6 916 aa22.02■■□□□ 1.12
VGF-201ENST00000249330 POTEB3A0JP26 581 aa22.01■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 POTECB2RU33 542 aa22.01■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 E9PMD0 336 aa22.01■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 EMC10Q5UCC4 262 aa22.01■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 SFMBT2Q5VUG0 894 aa22.01■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 POTEBQ6S5H4 581 aa22.01■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 SULF1Q8IWU6 871 aa22.01■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 RAD54LQ92698 747 aa22.01■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 MED24O75448 989 aa22.01■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 PPP1R37O75864 691 aa22.01■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 FSBPO95073 299 aa22.01■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 SERPING1P05155 500 aa22.01■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 NAA35Q5VZE5 725 aa22.01■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa22.01■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa22.01■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 PAGR1Q9BTK6 254 aa22.01■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 NLRC4Q9NPP4 1024 aa22.01■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 CEP72Q9P209 647 aa22.01■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 RIPK3Q9Y572 518 aa22.01■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 VWA5AO00534 786 aa22■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 FTCDO95954 541 aa22■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 ERCC3P19447 782 aa22■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 VGLL4Q14135 290 aa22■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 PTGISQ16647 500 aa22■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 PIK3R5Q8WYR1 880 aa22■■□□□ 1.11
VGF-201ENST00000249330 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms