RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243082.4

HOXC11-201, Transcript of homeobox C11, humanhuman

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Gene HOXC11, Length 2,039 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11-201ENST00000243082 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
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HOXC11-201ENST00000243082 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
HOXC11-201ENST00000243082 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
HOXC11-201ENST00000243082 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
HOXC11-201ENST00000243082 MKNK1Q9BUB5 465 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC11-201ENST00000243082 PLCB1Q9NQ66 1216 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC11-201ENST00000243082 CSADQ9Y600 493 aa20.28■□□□□ 0.84
HOXC11-201ENST00000243082 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa20.27■□□□□ 0.84
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HOXC11-201ENST00000243082 SFMBT2Q5VUG0 894 aa20.27■□□□□ 0.84
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HOXC11-201ENST00000243082 HS2ST1Q7LGA3 356 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC11-201ENST00000243082 FAM186BQ8IYM0 893 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC11-201ENST00000243082 SYT17Q9BSW7 474 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC11-201ENST00000243082 ANKEF1Q9NU02 776 aa20.27■□□□□ 0.84
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HOXC11-201ENST00000243082 PON1P27169 355 aa20.27■□□□□ 0.84
HOXC11-201ENST00000243082 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa20.27■□□□□ 0.84
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HOXC11-201ENST00000243082 DEF6Q9H4E7 631 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXC11-201ENST00000243082 LOC285556D6RIA3 1793 aa20.26■□□□□ 0.83
HOXC11-201ENST00000243082 AKR1B10O60218 316 aa20.26■□□□□ 0.83
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HOXC11-201ENST00000243082 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa20.26■□□□□ 0.83
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HOXC11-201ENST00000243082 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
HOXC11-201ENST00000243082 AIPL1Q9NZN9 384 aa20.26■□□□□ 0.83
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HOXC11-201ENST00000243082 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXC11-201ENST00000243082 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
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HOXC11-201ENST00000243082 CDHR1Q96JP9 859 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXC11-201ENST00000243082 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
HOXC11-201ENST00000243082 GPRC5CQ9NQ84 441 aa20.25■□□□□ 0.83
HOXC11-201ENST00000243082 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
HOXC11-201ENST00000243082 IRF6O14896 467 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC11-201ENST00000243082 ZNF862O60290 1169 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC11-201ENST00000243082 STBD1O95210 358 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC11-201ENST00000243082 UCHL3P15374 230 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC11-201ENST00000243082 CYP2J2P51589 502 aa20.24■□□□□ 0.83
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HOXC11-201ENST00000243082 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
HOXC11-201ENST00000243082 EHBP1Q8NDI1 1231 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC11-201ENST00000243082 DRC1Q96MC2 740 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC11-201ENST00000243082 IWS1Q96ST2 819 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC11-201ENST00000243082 TSGA10Q9BZW7 698 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC11-201ENST00000243082 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC11-201ENST00000243082 ELP3Q9H9T3 547 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC11-201ENST00000243082 SIX2Q9NPC8 291 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC11-201ENST00000243082 GABBR1Q9UBS5 961 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC11-201ENST00000243082 CNTN2Q02246 1040 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC11-201ENST00000243082 PPATQ06203 517 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC11-201ENST00000243082 RAPGEF1Q13905 1077 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC11-201ENST00000243082 MYBPC2Q14324 1141 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC11-201ENST00000243082 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
HOXC11-201ENST00000243082 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC11-201ENST00000243082 TMEM206Q9H813 350 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC11-201ENST00000243082 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
HOXC11-201ENST00000243082 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa20.24■□□□□ 0.83
HOXC11-201ENST00000243082 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
HOXC11-201ENST00000243082 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXC11-201ENST00000243082 GTF2BQ00403 316 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXC11-201ENST00000243082 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
HOXC11-201ENST00000243082 GADL1Q6ZQY3 521 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXC11-201ENST00000243082 HAUS6Q7Z4H7 955 aa20.23■□□□□ 0.83
HOXC11-201ENST00000243082 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
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