RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 BAIAP3O94812 1187 aa24.91■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 ACTN1P12814 892 aa24.91■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP24.91■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 CDC25AP30304 524 aa24.91■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 OTUD6AQ7L8S5 288 aa24.91■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP24.91■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 ANKEF1Q9NU02 776 aa24.91■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 PPME1Q9Y570 386 aa24.91■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa24.9■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 RARRES1P49788 294 aa24.9■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 WDR5P61964 334 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 KIZQ2M2Z5 673 aa24.9■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 XKR9Q5GH70 373 aa24.9■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 PPP1R16BQ96T49 567 aa24.9■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa24.9■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 MICAL3Q7RTP6 2002 aa24.9■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 ZBBXA8MT70 800 aa24.89■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 TMOD1P28289 359 aa24.89■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 GRIN1Q05586 938 aa24.89■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 IKBKEQ14164 716 aa24.89■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 POTEGQ6S5H5 508 aa24.89■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa24.89■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 ERMNQ8TAM6 284 aa24.89■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 SEPT8Q92599 483 aa24.89■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa24.89■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 AKT3Q9Y243 479 aa24.89■■□□□ 1.58
SYF2-201ENST00000236273 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 VWA3AA6NCI4 1184 aa24.88■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 MUTP22033 750 aa24.88■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 CD52P31358 61 aa24.88■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 GPC3P51654 580 aa24.88■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP24.88■■□□□ 1.576e-6■■■□□ 19.1
SYF2-201ENST00000236273 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 USP28Q96RU2 1077 aa24.88■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 M0QZ92 97 aa24.87■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 PBX2P40425 430 aa24.87■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 RFC5P40937 340 aa24.87■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 DEFB103AP81534 67 aa24.87■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 USP38Q8NB14 1042 aa24.87■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 APBB2Q92870 758 aa24.87■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 NACC1Q96RE7 527 aa24.87■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 OSMRQ99650 979 aa24.87■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 PADI3Q9ULW8 664 aa24.87■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 GINS2Q9Y248 185 aa24.87■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 BMP15O95972 392 aa24.86■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 HAUS3Q68CZ6 603 aa24.86■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa24.86■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 SNX29Q8TEQ0 813 aa24.86■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 SLC7A3Q8WY07 619 aa24.86■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 GBF1Q92538 1859 aa24.86■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 TMEM143Q96AN5 459 aa24.86■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 MAP7D2Q96T17 732 aa24.86■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 PBX4Q9BYU1 374 aa24.86■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 RAB34Q9BZG1 259 aa24.86■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 TMX1Q9H3N1 280 aa24.86■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 ERVK-5Q9HDB9 667 aa24.86■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 ZDHHC9Q9Y397 364 aa24.86■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 CHD9Q3L8U1 2897 aa24.86■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 MYH15Q9Y2K3 1946 aa24.86■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 EMC2Q15006 297 aa24.86■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 KSR1Q8IVT5 923 aa24.86■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 LINC01599Q8WXQ3 324 aa24.86■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 PNMA5Q96PV4 448 aa24.86■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 KIAA1024Q9UPX6 916 aa24.86■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 STK24Q9Y6E0 443 aa24.86■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 EFCAB14O75071 495 aa24.85■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 F13A1P00488 732 aa24.85■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 RABGGTBP53611 331 aa24.85■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 HYIQ5T013 277 aa24.85■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 KRT79Q5XKE5 535 aa24.85■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 GPR153Q6NV75 609 aa24.85■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 KCNK18Q7Z418 384 aa24.85■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 FAM228AQ86W67 206 aa24.85■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 EXOC8Q8IYI6 725 aa24.85■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 ZNF710Q8N1W2 664 aa24.85■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 SLC9A7Q96T83 725 aa24.85■■□□□ 1.57
SYF2-201ENST00000236273 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms