RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225576.7

TVP23C-201, Transcript of trans-golgi network vesicle protein 23 homolog C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TVP23C, Length 1,527 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23C-201ENST00000225576 FAM160B1Q5W0V3 765 aa18.51■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 MAEAQ7L5Y9 396 aa18.51■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 CCDC102AQ96A19 550 aa18.51■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 PCYT2Q99447 389 aa18.51■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 SH2D3AQ9BRG2 576 aa18.51■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa18.51■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 C17orf75Q9HAS0 396 aa18.51■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 VTA1Q9NP79 307 aa18.51■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 PDLIM7Q9NR12 457 aa18.51■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 CYP26B1Q9NR63 512 aa18.51■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 NRDCO43847 1150 aa18.5■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 OATP04181 439 aa18.5■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 SKILP12757 684 aa18.5■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 ATP4AP20648 1035 aa18.5■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 RPL13P26373 211 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 CLCN1P35523 988 aa18.5■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 TRIM14Q14142 442 aa18.5■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 DPP9Q86TI2 863 aa18.5■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 PPFIBP1Q86W92 1011 aa18.5■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 IFNL1Q8IU54 200 aa18.5■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 SMC1BQ8NDV3 1235 aa18.5■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 CCDC112Q8NEF3 446 aa18.5■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 MCPH1Q8NEM0 835 aa18.5■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 KIFAP3Q92845 792 aa18.5■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 CPA4Q9UI42 421 aa18.5■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 TGFB1I1O43294 461 aa18.49■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 TXNP10599 105 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 NR2F2P24468 414 aa18.49■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 STAT5BP51692 787 aa18.49■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 RTP1P59025 263 aa18.49■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 KCNA1Q09470 495 aa18.49■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa18.49■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 VWA3BQ502W6 1294 aa18.49■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 HHIPL1Q96JK4 782 aa18.49■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 GPR20Q99678 358 aa18.49■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 TMX1Q9H3N1 280 aa18.49■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 NRBP2Q9NSY0 501 aa18.49■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 SLC5A4Q9NY91 659 aa18.49■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 LGR5O75473 907 aa18.49■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 HSPA6P17066 643 aa18.49■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 CCDC40Q4G0X9 1142 aa18.49■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 FKBP15Q5T1M5 1219 aa18.49■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 FAM102BQ5T8I3 360 aa18.49■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 TAPT1Q6NXT6 567 aa18.49■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 TC2NQ8N9U0 490 aa18.49■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 GOLGA5Q8TBA6 731 aa18.49■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 ERGIC2Q96RQ1 377 aa18.49■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 NDST4Q9H3R1 872 aa18.49■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa18.48■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 K7ENM7 598 aa18.48■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 PES1O00541 588 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 TLR2O60603 784 aa18.48■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 NR3C1P04150 777 aa18.48■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 TPM1P09493 284 aa18.48■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 NCKAP1LP55160 1127 aa18.48■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 GTF2BQ00403 316 aa18.48■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 RBL2Q08999 1139 aa18.48■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 SREBF2Q12772 1141 aa18.48■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 C17orf99Q6UX52 265 aa18.48■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 SPIRE2Q8WWL2 714 aa18.48■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 MAML3Q96JK9 1138 aa18.48■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 FAM167AQ96KS9 214 aa18.48■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 GBP3Q9H0R5 595 aa18.48■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 AZI2Q9H6S1 392 aa18.48■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 TMEM206Q9H813 350 aa18.48■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa18.48■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 GPRC5CQ9NQ84 441 aa18.48■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 PDGFCQ9NRA1 345 aa18.48■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 KCNG1Q9UIX4 513 aa18.48■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 PPME1Q9Y570 386 aa18.48■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 NOP56O00567 594 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP18.47■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 KCNJ6P48051 423 aa18.47■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 SMTNP53814 917 aa18.47■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 PEX3P56589 373 aa18.47■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 HSDL1Q3SXM5 330 aa18.47■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 CEP135Q66GS9 1140 aa18.47■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 HS2ST1Q7LGA3 356 aa18.47■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa18.47■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 HAUS6Q7Z4H7 955 aa18.47■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 FRMD5Q7Z6J6 570 aa18.47■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 TRIM59Q8IWR1 403 aa18.47■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 SPATA33Q96N06 139 aa18.47■□□□□ 0.55
TVP23C-201ENST00000225576 PANX2Q96RD6 677 aa18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms