RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222305.7

USF2-201, Transcript of upstream transcription factor 2, c-fos interacting, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USF2, Length 1,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2-201ENST00000222305 FRMD3A2A2Y4 597 aa25.5■■□□□ 1.67
USF2-201ENST00000222305 MSCO60682 206 aa25.5■■□□□ 1.67
USF2-201ENST00000222305 TBCAO75347 108 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
USF2-201ENST00000222305 DGAT1O75907 488 aa25.5■■□□□ 1.67
USF2-201ENST00000222305 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
USF2-201ENST00000222305 SOX10P56693 466 aa25.5■■□□□ 1.67
USF2-201ENST00000222305 MAPK7Q13164 816 aa25.5■■□□□ 1.67
USF2-201ENST00000222305 MTFR1Q15390 333 aa25.5■■□□□ 1.67
USF2-201ENST00000222305 KIAA0753Q2KHM9 967 aa25.5■■□□□ 1.67
USF2-201ENST00000222305 LHX8Q68G74 356 aa25.5■■□□□ 1.67
USF2-201ENST00000222305 TSPY26PQ9H489 355 aa25.5■■□□□ 1.67
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USF2-201ENST00000222305 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa25.5■■□□□ 1.67
USF2-201ENST00000222305 GDAQ9Y2T3 454 aa25.5■■□□□ 1.67
USF2-201ENST00000222305 INSRRP14616 1297 aa25.49■■□□□ 1.67
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USF2-201ENST00000222305 MFSD10Q14728 455 aa25.49■■□□□ 1.67
USF2-201ENST00000222305 EMC2Q15006 297 aa25.49■■□□□ 1.67
USF2-201ENST00000222305 ANO6Q4KMQ2 910 aa25.49■■□□□ 1.67
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USF2-201ENST00000222305 KLHDC9Q8NEP7 349 aa25.49■■□□□ 1.67
USF2-201ENST00000222305 DNAJC25Q9H1X3 360 aa25.49■■□□□ 1.67
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USF2-201ENST00000222305 ODF2LQ9ULJ1 636 aa25.49■■□□□ 1.67
USF2-201ENST00000222305 FAM13AO94988 1023 aa25.48■■□□□ 1.67
USF2-201ENST00000222305 PSEN2P49810 448 aa25.48■■□□□ 1.67
USF2-201ENST00000222305 EHHADHQ08426 723 aa25.48■■□□□ 1.67
USF2-201ENST00000222305 FAM102BQ5T8I3 360 aa25.48■■□□□ 1.67
USF2-201ENST00000222305 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
USF2-201ENST00000222305 GAS2L3Q86XJ1 694 aa25.48■■□□□ 1.67
USF2-201ENST00000222305 SFR1Q86XK3 245 aa25.48■■□□□ 1.67
USF2-201ENST00000222305 TBC1D7Q9P0N9 293 aa25.48■■□□□ 1.67
USF2-201ENST00000222305 CST5P28325 142 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
USF2-201ENST00000222305 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa25.48■■□□□ 1.67
USF2-201ENST00000222305 KCNA10Q16322 511 aa25.48■■□□□ 1.67
USF2-201ENST00000222305 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
USF2-201ENST00000222305 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
USF2-201ENST00000222305 CXCL17Q6UXB2 119 aa25.48■■□□□ 1.67
USF2-201ENST00000222305 ZBTB10Q96DT7 871 aa25.48■■□□□ 1.67
USF2-201ENST00000222305 SLC39A2Q9NP94 309 aa25.48■■□□□ 1.67
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USF2-201ENST00000222305 ZEB2O60315 1214 aa25.47■■□□□ 1.67
USF2-201ENST00000222305 KPNA6O60684 536 aa25.47■■□□□ 1.67
USF2-201ENST00000222305 RFC5P40937 340 aa25.47■■□□□ 1.67
USF2-201ENST00000222305 STK4Q13043 487 aa25.47■■□□□ 1.67
USF2-201ENST00000222305 PPFIA1Q13136 1202 aa25.47■■□□□ 1.67
USF2-201ENST00000222305 ZNF484Q5JVG2 852 aa25.47■■□□□ 1.67
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USF2-201ENST00000222305 TIPINQ9BVW5 301 aa25.47■■□□□ 1.67
USF2-201ENST00000222305 PARVGQ9HBI0 331 aa25.47■■□□□ 1.67
USF2-201ENST00000222305 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa25.47■■□□□ 1.67
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USF2-201ENST00000222305 PRDM10Q9NQV6 1147 aa25.46■■□□□ 1.67
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USF2-201ENST00000222305 COL1A2P08123 1366 aa25.46■■□□□ 1.67
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USF2-201ENST00000222305 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa25.45■■□□□ 1.67
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USF2-201ENST00000222305 GLIS3Q8NEA6 775 aa25.45■■□□□ 1.67
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USF2-201ENST00000222305 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa25.45■■□□□ 1.67
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USF2-201ENST00000222305 LRRC71Q8N4P6 559 aa25.44■■□□□ 1.66
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USF2-201ENST00000222305 PRCPP42785 496 aa25.43■■□□□ 1.66
USF2-201ENST00000222305 ODR4Q5SWX8 454 aa25.43■■□□□ 1.66
USF2-201ENST00000222305 MLKLQ8NB16 471 aa25.43■■□□□ 1.66
USF2-201ENST00000222305 LMBR1Q8WVP7 490 aa25.43■■□□□ 1.66
USF2-201ENST00000222305 KIFAP3Q92845 792 aa25.43■■□□□ 1.66
USF2-201ENST00000222305 DEFB118Q96PH6 123 aa25.43■■□□□ 1.66
USF2-201ENST00000222305 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa25.42■■□□□ 1.66
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