RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027009.10

Casp12-201, Transcript of Caspase-12, mouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Casp12, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Wdr60	Q8C761	999 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gatad2a	Q8CHY6	629 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ces2a	Q8QZR3	558 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tymp	Q99N42	471 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rpain	Q9CWY9	219 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Chtop	Q9CY57	249 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Lrrc71	Q9D3W5	558 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rnf125	Q9D9R0	233 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ehhadh	Q9DBM2	718 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Elf2	Q9JHC9	593 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	St6galnac1	Q9QZ39	526 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tchh	A0A0B4J1F9	1599 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Syndig1	A2ANU3	258 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr1032	A2ATE5	310 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm11756	A2BEJ1	356 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm973	E9Q295	1059 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cdk2ap1	O35207	114 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Akr1b8	P45377	316 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Igfbp4	P47879	254 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cpne7	Q0VE82	557 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Limch1	Q3UH68	1057 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zbtb16	Q3UQ17	673 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Krt35	Q497I4	455 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nfkbib	Q60778	359 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Krt32	Q62168	407 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Srms	Q62270	496 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr798	Q7TRH8	311 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dsg1b	Q7TSF1	1060 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tmem127	Q8BGP5	238 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Galnt12	Q8BGT9	576 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Lrch3	Q8BVU0	778 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zc3h6	Q8BYK8	1177 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Casp9	Q8C3Q9	454 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mtrf1	Q8K126	446 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ddx54	Q8K4L0	874 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Acat1	Q8QZT1	424 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Vmn1r214	Q8R279	367 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Atxn7	Q8R4I1	867 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Nsmf	Q99NF2	532 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Iyd	Q9DCX8	285 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pde7b	Q9QXQ1	446 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Spry1	Q9QXV9	313 aa		4.5	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cep85l	A0A1W2P884	806 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cyb5rl	B1AS42	316 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Scgb1b24	B1B0N6	92 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zbtb21	E9Q444	1094 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm4788	E9Q8B5	879 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rad51b	O35719	350 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Prl7d1	P04769	244 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Junb	P09450	344 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gadd45b	P22339	160 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Cd63	P41731	238 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pold1	P52431	1105 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Smad1	P70340	465 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Arvcf	P98203	962 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gbp1	Q01514	589 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pex1	Q5BL07	1284 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Slc44a5	Q5RJI2	710 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gpr156	Q6PCP7	798 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ccsmst1	Q6RUT7	136 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sdr16c5	Q7TQA3	309 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sytl5	Q80T23	753 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sgsm2	Q80U12	1005 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fam205c	Q80YD3	371 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Hpcal4	Q8BGZ1	191 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Als2cr12	Q8BVM7	383 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Trerf1	Q8BXJ2	1205 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fsd2	Q8BZ52	692 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Zfp317	Q8C0Q5	607 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Immt	Q8CAQ8	757 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Vps50	Q8CI71	964 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Hpgd	Q8VCC1	269 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr356	Q8VFP5	315 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rest	Q8VIG1	1082 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ghitm	Q91VC9	346 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Pcdhb13	Q91Y06	796 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Lrp8	Q924X6	996 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tpgs1	Q99MS8	303 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Antxr1	Q9CZ52	562 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ndc80	Q9D0F1	642 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mphosph6	Q9D1Q1	161 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Ubxn11	Q9D572	484 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	C1qtnf2	Q9D8U4	294 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Tle2	Q9WVB2	767 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Clip2	Q9Z0H8	1047 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Eif2ak3	Q9Z2B5	1114 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Rnf123	Q5XPI3	1314 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Shroom4	Q1W617	1475 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Iqcj-Schip1	A0A088MLT8	559 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Sycp2l	A0A0M3U1B0	842 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Gm16368	A0A1Y7VNG9	144 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Arhgap27	A2AB59	869 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Upf2	A2AT37	1269 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Mroh4	G3X8W1	983 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Olfr117	L7N1Z1	317 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	B3galt2	O54905	422 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Dxo	O70348	397 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Schip1	P0DPB4	484 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fgl2	P12804	432 aa		4.49	□□□□□ -1.69
Casp12-201	ENSMUST00000027009	Fes	P16879	822 aa		4.49	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.1 ms