RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635751.1

CLN8-208, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-208ENST00000635751 POTEB3A0JP26 581 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 WDR64B1ANS9 1081 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 SLITRK3O94933 977 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 RPA1P27694 616 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 SFNP31947 248 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 JAK3P52333 1124 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 ACTR2P61160 394 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 IQSEC1Q6DN90 963 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 POTEBQ6S5H4 581 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 METTL7BQ6UX53 244 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 PDCL2Q8N4E4 241 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 RAET1EQ8TD07 263 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 LRRC15Q8TF66 581 aa22.1■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 ADCY3O60266 1144 aa22.09■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 SMPD1P17405 629 aa22.09■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 ADKP55263 362 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 ETF1P62495 437 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
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CLN8-208ENST00000635751 TRIM32Q13049 653 aa22.09■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 HYIQ5T013 277 aa22.09■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa22.09■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 TPH2Q8IWU9 490 aa22.09■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 REXO1L1PQ8IX06 675 aa22.09■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 BANK1Q8NDB2 785 aa22.09■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 KIAA1024Q9UPX6 916 aa22.09■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 TRIM17Q9Y577 477 aa22.09■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa22.09■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa22.08■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa22.08■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 PBX1P40424 430 aa22.08■■□□□ 1.13
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CLN8-208ENST00000635751 PANX2Q96RD6 677 aa22.08■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 CUEDC2Q9H467 287 aa22.08■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 MAGEF1Q9HAY2 307 aa22.08■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa22.08■■□□□ 1.13
CLN8-208ENST00000635751 POTEFA5A3E0 1075 aa22.08■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 TEX33O43247 280 aa22.08■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 ADCY6O43306 1168 aa22.08■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 SLU7O95391 586 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 TNFAIP2Q03169 654 aa22.08■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 KCNB1Q14721 858 aa22.08■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa22.08■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 TMEM119Q4V9L6 283 aa22.08■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 POTEGQ6S5H5 508 aa22.08■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 ABHD15Q6UXT9 468 aa22.08■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 PPFIBP1Q86W92 1011 aa22.08■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 TRPV1Q8NER1 839 aa22.08■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 RDM1Q8NG50 284 aa22.08■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 NELFBQ8WX92 580 aa22.08■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
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CLN8-208ENST00000635751 L2HGDHQ9H9P8 463 aa22.08■■□□□ 1.12
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CLN8-208ENST00000635751 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 SLC26A4O43511 780 aa22.07■■□□□ 1.12
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CLN8-208ENST00000635751 HSDL1Q3SXM5 330 aa22.07■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 KCNK18Q7Z418 384 aa22.07■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa22.07■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 SPATA33Q96N06 139 aa22.07■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 HTTP42858 3142 aa22.07■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa22.07■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 ITIH6Q6UXX5 1313 aa22.06■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa22.06■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 ATG7O95352 703 aa22.06■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 PSAPP07602 524 aa22.06■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa22.06■■□□□ 1.12
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CLN8-208ENST00000635751 KBTBD4Q9NVX7 518 aa22.06■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 E9PMD0 336 aa22.06■■□□□ 1.12
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CLN8-208ENST00000635751 PRMT2P55345 433 aa22.06■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 PSMC6P62333 389 aa22.06■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 LAMC2Q13753 1193 aa22.06■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 SWSAP1Q6NVH7 229 aa22.06■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 TRIM65Q6PJ69 517 aa22.06■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 NEK9Q8TD19 979 aa22.06■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 SEPT1Q8WYJ6 367 aa22.06■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa22.06■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 GABBR1Q9UBS5 961 aa22.06■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 FAM184BQ9ULE4 1060 aa22.06■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 LRRC10BA6NIK2 292 aa22.05■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 NOP56O00567 594 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa22.05■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 PRCPP42785 496 aa22.05■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 QARSP47897 775 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 KRT31Q15323 416 aa22.05■■□□□ 1.12
CLN8-208ENST00000635751 UGCGQ16739 394 aa22.05■■□□□ 1.12
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