RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAPNS1-215	ENST00000628018	CYP2B6	P20813	491 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CAPNS1-215	ENST00000628018	CCNE1	P24864	410 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CAPNS1-215	ENST00000628018	MAP2K2	P36507	400 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CAPNS1-215	ENST00000628018	FCGRT	P55899	365 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CAPNS1-215	ENST00000628018	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	27.59	■■■□□ 2.01
CAPNS1-215	ENST00000628018	MAPK7	Q13164	816 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CAPNS1-215	ENST00000628018	LAMC2	Q13753	1193 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CAPNS1-215	ENST00000628018	FAM160B1	Q5W0V3	765 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CAPNS1-215	ENST00000628018	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
CAPNS1-215	ENST00000628018	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CAPNS1-215	ENST00000628018	TIPIN	Q9BVW5	301 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CAPNS1-215	ENST00000628018	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CAPNS1-215	ENST00000628018	POLD4	Q9HCU8	107 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CAPNS1-215	ENST00000628018	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CAPNS1-215	ENST00000628018	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		27.59	■■■□□ 2.01
CAPNS1-215	ENST00000628018	GH1	P01241	217 aa		27.58	■■■□□ 2.01
CAPNS1-215	ENST00000628018	IGHA2	P01877	340 aa		27.58	■■■□□ 2.01
CAPNS1-215	ENST00000628018	STAT5B	P51692	787 aa		27.58	■■■□□ 2.01
CAPNS1-215	ENST00000628018	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
CAPNS1-215	ENST00000628018	LRRC41	Q15345	812 aa		27.58	■■■□□ 2.01
CAPNS1-215	ENST00000628018	P2RX5	Q93086	422 aa		27.58	■■■□□ 2.01
CAPNS1-215	ENST00000628018	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
CAPNS1-215	ENST00000628018	PARVG	Q9HBI0	331 aa		27.58	■■■□□ 2.01
CAPNS1-215	ENST00000628018	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
CAPNS1-215	ENST00000628018	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	TRIM49B	A6NDI0	452 aa		27.57	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	SFI1	A8K8P3	1242 aa		27.57	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	27.57	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	HIP1R	O75146	1068 aa		27.57	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	OAT	P04181	439 aa		27.57	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	ATP1A3	P13637	1013 aa		27.57	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	PSMC4	P43686	418 aa		27.57	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	CCL14	Q16627	93 aa		27.57	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		27.57	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	CENPP	Q6IPU0	288 aa		27.57	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	TTI2	Q6NXR4	508 aa		27.57	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	MYOCD	Q8IZQ8	938 aa		27.57	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	DAW1	Q8N136	415 aa		27.57	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	CEP170P1	Q96L14	293 aa		27.57	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	TRIM47	Q96LD4	638 aa		27.57	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	TRIM5	Q9C035	493 aa		27.57	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	SEL1L	Q9UBV2	794 aa		27.57	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	SEPT9	Q9UHD8	586 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		27.57	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	BICDL2	A1A5D9	508 aa		27.57	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	TBC1D8	O95759	1140 aa		27.57	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	VEGFB	P49765	207 aa		27.57	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		27.57	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		27.57	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		27.57	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	CYP26B1	Q9NR63	512 aa		27.57	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	EMSY	Q7Z589	1322 aa		27.56	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	PTGS1	P23219	599 aa		27.56	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	ZNF75D	P51815	510 aa		27.56	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		27.56	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		27.56	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	EPM2AIP1	Q7L775	607 aa	Predicted RBP	27.56	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	MYCT1	Q8N699	235 aa		27.56	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		27.56	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	27.56	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	AZI2	Q9H6S1	392 aa		27.56	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	27.55	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	SMPD1	P17405	629 aa		27.55	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	27.55	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		27.55	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	PLPPR4	Q7Z2D5	763 aa		27.55	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	FIZ1	Q96SL8	496 aa		27.55	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	27.55	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	KIF20A	O95235	890 aa		27.54	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	CASP5	P51878	434 aa		27.54	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	FANCC	Q00597	558 aa		27.54	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		27.54	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	MRPL44	Q9H9J2	332 aa	Known RBP	27.54	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		27.54	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		27.54	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	RNF186	Q9NXI6	227 aa		27.54	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	MYH11	P35749	1972 aa		27.53	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	DGAT1	O75907	488 aa		27.53	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	27.53	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	CYP2C19	P33261	490 aa		27.53	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	SP3	Q02447	781 aa		27.53	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		27.53	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		27.53	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	PPTC7	Q8NI37	304 aa		27.53	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		27.53	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		27.52	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		27.52	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	GLG1	Q92896	1179 aa		27.52	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	FAM167A	Q96KS9	214 aa		27.52	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	DRC1	Q96MC2	740 aa		27.52	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	CEP89	Q96ST8	783 aa		27.52	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	ADCY6	O43306	1168 aa		27.51	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	TRPA1	O75762	1119 aa		27.51	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	MYB	P10242	640 aa		27.51	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	27.51	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	SLC26A2	P50443	739 aa		27.51	■■■□□ 2
CAPNS1-215	ENST00000628018	HTRA3	P83110	453 aa		27.51	■■■□□ 2

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