RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627568.2

TCF4-259, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 806 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-259	ENST00000627568	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	29.01	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	29.01	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	LINC01599	Q8WXQ3	324 aa		29.01	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	FAM167A	Q96KS9	214 aa		29.01	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		29.01	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	ATP4A	P20648	1035 aa		29	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	ODR4	Q5SWX8	454 aa		29	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	NPAS4	Q8IUM7	802 aa		29	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	29	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	TBCK	Q8TEA7	893 aa		29	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	RC3H2	Q9HBD1	1191 aa	Known RBP	29	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		29	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	GAS7	O60861	476 aa		28.99	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	STAG3L1	P0CL83	205 aa		28.99	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	28.99	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	28.99	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		28.99	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	RIT2	Q99578	217 aa		28.99	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	28.99	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	28.99	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		28.98	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	MSH4	O15457	936 aa		28.98	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	RPS6KA5	O75582	802 aa		28.98	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	DGKI	O75912	1065 aa		28.98	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	CDKL5	O76039	1030 aa		28.98	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	C22orf31	O95567	290 aa		28.98	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	RB1	P06400	928 aa		28.98	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		28.98	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	GALNT17	Q6IS24	598 aa		28.98	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	BLID	Q8IZY5	108 aa		28.98	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	METTL13	Q8N6R0	699 aa		28.98	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	ZNF689	Q96CS4	500 aa	Predicted RBP	28.98	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	28.98	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		28.98	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	DISC1	Q9NRI5	854 aa		28.98	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	MYO7A	Q13402	2215 aa		28.97	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	BMPR1A	P36894	532 aa		28.97	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	JAK3	P52333	1124 aa		28.97	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		28.97	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		28.97	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	BANK1	Q8NDB2	785 aa		28.97	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		28.97	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		28.96	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	MAGEB2	O15479	319 aa		28.96	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	CHMP2A	O43633	222 aa		28.96	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	SFN	P31947	248 aa		28.96	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	28.96	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	28.96	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	28.96	■■■□□ 2.23
TCF4-259	ENST00000627568	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		28.95	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	28.95	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	SLC5A5	Q92911	643 aa		28.95	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	MAP7D2	Q96T17	732 aa		28.95	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		28.95	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	28.95	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		28.95	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		28.95	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	28.95	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	DENND3	A2RUS2	1198 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	GPR182	O15218	404 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	EDIL3	O43854	480 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	OAT	P04181	439 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	XBP1	P17861	261 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	28.94	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	PRKCE	Q02156	737 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	28.94	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568		Q4G0T1	1027 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	AIFM3	Q96NN9	605 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	LMAN2L	Q9H0V9	348 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	TMX1	Q9H3N1	280 aa		28.94	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	VTN	P04004	478 aa		28.93	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	28.93	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	KCNA5	P22460	613 aa		28.93	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	TMOD1	P28289	359 aa		28.93	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	SCRN1	Q12765	414 aa		28.93	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		28.93	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	RDM1	Q8NG50	284 aa		28.93	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		28.93	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	OSMR	Q99650	979 aa		28.93	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	PLVAP	Q9BX97	442 aa		28.93	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		28.93	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		28.93	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	AKT3	Q9Y243	479 aa		28.93	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	TDP2	O95551	362 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	LINC00271	P0C7V0	271 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	SARS	P49591	514 aa	Known RBP	28.92	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	CLCN3	P51790	818 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	ANAPC15	P60006	121 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	28.92	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		28.92	■■■□□ 2.22
TCF4-259	ENST00000627568	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		28.91	■■■□□ 2.22

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