RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 KAT6AQ92794 2004 aa9.51□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM150BA6NC51 233 aa9.51□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 MOXD2PA6NHM9 499 aa9.51□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 DDX11L8A8MPP1 907 aa9.51□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 E9PMD0 336 aa9.51□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 DNM1LO00429 736 aa9.51□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 ZBTB39O15060 712 aa9.51□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 LYPLA2O95372 231 aa9.51□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 MUTP22033 750 aa9.51□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 YWHABP31946 246 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
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SGMS1-211ENST00000626236 SLC26A2P50443 739 aa9.51□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 MFSD10Q14728 455 aa9.51□□□□□ -0.89
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SGMS1-211ENST00000626236 TMEM119Q4V9L6 283 aa9.51□□□□□ -0.89
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SGMS1-211ENST00000626236 PIGOQ8TEQ8 1089 aa9.51□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 ATP8B4Q8TF62 1192 aa9.51□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa9.51□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 KAT2BQ92831 832 aa9.51□□□□□ -0.89
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SGMS1-211ENST00000626236 FAM167AQ96KS9 214 aa9.51□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
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SGMS1-211ENST00000626236 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
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SGMS1-211ENST00000626236 NRBP2Q9NSY0 501 aa9.51□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 HPSEQ9Y251 543 aa9.51□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa9.5□□□□□ -0.89
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SGMS1-211ENST00000626236 A0A1W2PQY0 241 aa9.5□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 HAS3O00219 553 aa9.5□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 CABYRO75952 493 aa9.5□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 STBD1O95210 358 aa9.5□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
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SGMS1-211ENST00000626236 FAM160A1Q05DH4 1040 aa9.5□□□□□ -0.89
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SGMS1-211ENST00000626236 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
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SGMS1-211ENST00000626236 RAD54LQ92698 747 aa9.5□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 CEP170P1Q96L14 293 aa9.5□□□□□ -0.89
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SGMS1-211ENST00000626236 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa9.49□□□□□ -0.89
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SGMS1-211ENST00000626236 E2F4Q16254 413 aa9.49□□□□□ -0.89
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SGMS1-211ENST00000626236 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa9.49□□□□□ -0.89
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SGMS1-211ENST00000626236 SERTAD1Q9UHV2 236 aa9.49□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 BOLA1Q9Y3E2 137 aa9.49□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 MYH11P35749 1972 aa9.49□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
SGMS1-211ENST00000626236 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
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