RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 GUCY2FP51841 1108 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 ABCB5Q2M3G0 1257 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 IFT20Q8IY31 132 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 SPICE1Q8N0Z3 855 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 IFT81Q8WYA0 676 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 GCNT4Q9P109 453 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 SPDYE3A6NKU9 549 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 GCNT3O95395 438 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 EYA4O95677 639 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 GH2P01242 217 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 CYP3A4P08684 503 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 NMT1P30419 496 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 SLC20A2Q08357 652 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 PPFIA1Q13136 1202 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 BTNL9Q6UXG8 535 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 MREGQ8N565 214 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 TPCN2Q8NHX9 752 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 ERMNQ8TAM6 284 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 HSD17B14Q9BPX1 270 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 GPR88Q9GZN0 384 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 RABEP2Q9H5N1 569 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 ATRNL1Q5VV63 1379 aa14.61□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 KCNK3O14649 394 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 CALUO43852 315 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 PODNQ7Z5L7 613 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 SCFD2Q8WU76 684 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 FBXL5Q9UKA1 691 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 MYH11P35749 1972 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 CES2O00748 559 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 ECE2O60344 883 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 C1orf186Q6ZWK4 172 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 KLHL7Q8IXQ5 586 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 SPAG5Q96R06 1193 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 MRIQ9BWK5 157 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 NEUROG2Q9H2A3 272 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 OLFML3Q9NRN5 406 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 PRR12Q9ULL5 1215 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 SLITRK3O94933 977 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 ECE1P42892 770 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 SKOR1P84550 965 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 STRIP1Q5VSL9 837 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 KCTD16Q68DU8 428 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 OTOP1Q7RTM1 612 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 SLFN11Q7Z7L1 901 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 CAPS2Q9BXY5 557 aa14.6□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 PIK3CDO00329 1044 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 HSF2BPO75031 334 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 BMP3P12645 472 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 PAK2Q13177 524 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 METTL13Q8N6R0 699 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 SLC30A5Q8TAD4 765 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 SYT11Q9BT88 431 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 PSMD10O75832 226 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 GNGT1P63211 74 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 SKIDA1Q1XH10 827 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 TCERG1LQ5VWI1 586 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 MASTLQ96GX5 879 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 DYDC2Q96IM9 177 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 RASSF4Q9H2L5 321 aa14.59□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 NPM3O75607 178 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 FOSP01100 380 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 ITGA4P13612 1032 aa14.58□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 ALDH1B1P30837 517 aa14.58□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 CORO7P57737 925 aa14.58□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 IKQ13123 557 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 RPS6KA1Q15418 735 aa14.58□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 C10orf76Q5T2E6 689 aa14.58□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 GBP6Q6ZN66 633 aa14.58□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 ACTRT1Q8TDG2 376 aa14.58□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 AP1M1Q9BXS5 423 aa14.58□□□□□ -0.07
C9orf170-201ENST00000623052 ATP8B3O60423 1300 aa14.58□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 FAM170AA1A519 330 aa14.58□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 G3V3G9 751 aa14.58□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 OPA1O60313 960 aa14.58□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 UBXN2AP68543 259 aa14.58□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 CBWD6Q4V339 395 aa14.58□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 CBWD3Q5JTY5 395 aa14.58□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 CBWD5Q5RIA9 395 aa14.58□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 DCAF8Q5TAQ9 597 aa14.58□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 BANK1Q8NDB2 785 aa14.58□□□□□ -0.08
C9orf170-201ENST00000623052 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms