RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610468.4

MUC1-222, Transcript of mucin 1, cell surface associated, human

TSL 1 (best)

Gene MUC1, Length 1,162 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC1-222	ENST00000610468	ADAM15	Q13444	863 aa		15.81	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		15.81	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	MCTP2	Q6DN12	878 aa		15.81	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		15.81	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	PLA2G4D	Q86XP0	818 aa		15.81	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		15.81	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		15.81	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	KCNB2	Q92953	911 aa		15.81	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		15.81	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		15.81	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		15.8	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	15.8	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	LINC01565	O15544	149 aa		15.8	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	C22orf31	O95567	290 aa		15.8	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	EYA4	O95677	639 aa		15.8	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	15.8	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF76	P36508	570 aa		15.8	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	15.8	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	PAN2	Q504Q3	1202 aa	Known RBP	15.8	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF484	Q5JVG2	852 aa		15.8	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		15.8	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	15.8	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		15.8	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	EFHB	Q8N7U6	833 aa		15.8	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		15.8	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	15.8	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		15.8	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF302	Q9NR11	478 aa		15.8	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		15.8	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	15.8	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	15.8	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	MYO7A	Q13402	2215 aa		15.8	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	PIEZO1	Q92508	2521 aa		15.79	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468		C9IYK1	514 aa		15.79	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	ADAMTS3	O15072	1205 aa		15.79	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	CDC45	O75419	566 aa		15.79	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	RPS6KA5	O75582	802 aa		15.79	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	IRS1	P35568	1242 aa		15.79	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	GATM	P50440	423 aa		15.79	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	15.79	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	15.79	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	CLUL1	Q15846	466 aa		15.79	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	PKN1	Q16512	942 aa		15.79	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	SWSAP1	Q6NVH7	229 aa		15.79	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	SLC24A5	Q71RS6	500 aa		15.79	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		15.79	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	15.79	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	FBXL16	Q8N461	479 aa		15.79	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	POF1B	Q8WVV4	589 aa		15.79	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	15.79	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	15.79	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	RGS18	Q9NS28	235 aa		15.79	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		15.79	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	15.79	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	CD207	Q9UJ71	328 aa		15.79	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		15.79	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	KAT6A	Q92794	2004 aa		15.78	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		15.78	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		15.78	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	GPR182	O15218	404 aa		15.78	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	CIITA	P33076	1130 aa		15.78	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	15.78	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	UBE3A	Q05086	875 aa		15.78	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	ODR4	Q5SWX8	454 aa		15.78	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	15.78	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		15.78	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	15.78	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	LENG9	Q96B70	501 aa		15.78	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	ADAM2	Q99965	735 aa		15.78	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF577	Q9BSK1	485 aa		15.78	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	IGFLR1	Q9H665	355 aa		15.78	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	CLEC1B	Q9P126	229 aa		15.78	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		15.78	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	GINS2	Q9Y248	185 aa		15.78	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		15.78	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	DENND3	A2RUS2	1198 aa		15.77	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	15.77	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	GPR32	O75388	356 aa		15.77	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	CSPG5	O95196	566 aa		15.77	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	GLP2R	O95838	553 aa		15.77	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	NDUFV1	P49821	464 aa		15.77	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	FAM189B	P81408	668 aa		15.77	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	COASY	Q13057	564 aa		15.77	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	DSC3	Q14574	896 aa		15.77	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		15.77	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	15.77	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	FAM228A	Q86W67	206 aa		15.77	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		15.77	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		15.77	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	C6orf50	Q9HD87	102 aa		15.77	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		15.77	■□□□□ 0.12
MUC1-222	ENST00000610468	PSAP	P07602	524 aa		15.76	■□□□□ 0.11
MUC1-222	ENST00000610468	CPA1	P15085	419 aa		15.76	■□□□□ 0.11
MUC1-222	ENST00000610468	GNA11	P29992	359 aa		15.76	■□□□□ 0.11
MUC1-222	ENST00000610468	NRIP1	P48552	1158 aa		15.76	■□□□□ 0.11
MUC1-222	ENST00000610468	FGD1	P98174	961 aa		15.76	■□□□□ 0.11
MUC1-222	ENST00000610468	APOBR	Q0VD83	1088 aa		15.76	■□□□□ 0.11
MUC1-222	ENST00000610468	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		15.76	■□□□□ 0.11
MUC1-222	ENST00000610468	BRF1	Q92994	677 aa		15.76	■□□□□ 0.11
MUC1-222	ENST00000610468	OSMR	Q99650	979 aa		15.76	■□□□□ 0.11

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