RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609284.1

NUP50-AS1-203, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NUP50-AS1, Length 710 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-203ENST00000609284 XKR3Q5GH77 459 aa9.98□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 OLFML2BQ68BL8 750 aa9.98□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CENPPQ6IPU0 288 aa9.98□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TAPT1Q6NXT6 567 aa9.98□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ANO5Q75V66 913 aa9.98□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 OTUD6AQ7L8S5 288 aa9.98□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 EEPD1Q7L9B9 569 aa9.98□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 HPS3Q969F9 1004 aa9.98□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 FAM167AQ96KS9 214 aa9.98□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TRIM47Q96LD4 638 aa9.98□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 DRC1Q96MC2 740 aa9.98□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ZIC5Q96T25 663 aa9.98□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 GPR20Q99678 358 aa9.98□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TRIM5Q9C035 493 aa9.98□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa9.98□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SLC39A2Q9NP94 309 aa9.98□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ZNF302Q9NR11 478 aa9.98□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 FANCLQ9NW38 375 aa9.98□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 WBP1LQ9NX94 342 aa9.98□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TRIM49BA6NDI0 452 aa9.97□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 NOP56O00567 594 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ZBTB39O15060 712 aa9.97□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP9.97□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CBFA2T2O43439 604 aa9.97□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 USO1O60763 962 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 HIP1RO75146 1068 aa9.97□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 DGAT1O75907 488 aa9.97□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 GH1P01241 217 aa9.97□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 IGHA2P01877 340 aa9.97□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TXNP10599 105 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MAPTP10636 758 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ATP1A3P13637 1013 aa9.97□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SLC26A2P50443 739 aa9.97□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 STX17P56962 302 aa9.97□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 FANCCQ00597 558 aa9.97□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa9.97□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 LY6KQ17RY6 165 aa9.97□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 XKR9Q5GH70 373 aa9.97□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PLA2G4FQ68DD2 849 aa9.97□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SWSAP1Q6NVH7 229 aa9.97□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa9.97□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa9.97□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 FAM114A1Q8IWE2 563 aa9.97□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 DAW1Q8N136 415 aa9.97□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SLC17A8Q8NDX2 589 aa9.97□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MCPH1Q8NEM0 835 aa9.97□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 NPLOC4Q8TAT6 608 aa9.97□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SCFD1Q8WVM8 642 aa9.97□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SEPT1Q8WYJ6 367 aa9.97□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TSG101Q99816 390 aa9.97□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 THAP9Q9H5L6 903 aa9.97□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 BCAS3Q9H6U6 928 aa9.97□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MLXIPQ9HAP2 919 aa9.97□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa9.97□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TELO2Q9Y4R8 837 aa9.97□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa9.97□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ANK1P16157 1881 aa9.96□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa9.96□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SORBS3O60504 671 aa9.96□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PPP1R37O75864 691 aa9.96□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 TPM3P06753 285 aa9.96□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PMS1P54277 932 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 FCGRTP55899 365 aa9.96□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 RTP1P59025 263 aa9.96□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PLCB2Q00722 1185 aa9.96□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 LAMC2Q13753 1193 aa9.96□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 DEFB115Q30KQ5 88 aa9.96□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 EDRF1Q3B7T1 1238 aa9.96□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 DUSP28Q4G0W2 176 aa9.96□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 LRRC55Q6ZSA7 311 aa9.96□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa9.96□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 FAM178BQ8IXR5 827 aa9.96□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 GLIS3Q8NEA6 775 aa9.96□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa9.96□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PPTC7Q8NI37 304 aa9.96□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 KIFAP3Q92845 792 aa9.96□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 HVCN1Q96D96 273 aa9.96□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SPATA33Q96N06 139 aa9.96□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 CTAGE1Q96RT6 745 aa9.96□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 FIZ1Q96SL8 496 aa9.96□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 PCYT2Q99447 389 aa9.96□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa9.96□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 SEMA6BQ9H3T3 888 aa9.96□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa9.96□□□□□ -0.82
NUP50-AS1-203ENST00000609284 ZHX3Q9H4I2 956 aa9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms